Protein–RNA interactions for Protein: P28301

Lox, Protein-lysine 6-oxidase, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LoxP28301 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LoxP28301 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LoxP28301 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LoxP28301 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LoxP28301 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LoxP28301 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LoxP28301 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LoxP28301 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LoxP28301 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LoxP28301 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LoxP28301 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LoxP28301 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
LoxP28301 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LoxP28301 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LoxP28301 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LoxP28301 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LoxP28301 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LoxP28301 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LoxP28301 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LoxP28301 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LoxP28301 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LoxP28301 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LoxP28301 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LoxP28301 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LoxP28301 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LoxP28301 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LoxP28301 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LoxP28301 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LoxP28301 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LoxP28301 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
LoxP28301 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LoxP28301 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LoxP28301 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LoxP28301 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
LoxP28301 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LoxP28301 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LoxP28301 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LoxP28301 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LoxP28301 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LoxP28301 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LoxP28301 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LoxP28301 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LoxP28301 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LoxP28301 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LoxP28301 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LoxP28301 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LoxP28301 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LoxP28301 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LoxP28301 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LoxP28301 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LoxP28301 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LoxP28301 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LoxP28301 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LoxP28301 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LoxP28301 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LoxP28301 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LoxP28301 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LoxP28301 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LoxP28301 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LoxP28301 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LoxP28301 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LoxP28301 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
LoxP28301 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LoxP28301 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LoxP28301 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LoxP28301 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LoxP28301 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LoxP28301 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LoxP28301 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LoxP28301 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LoxP28301 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LoxP28301 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
LoxP28301 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LoxP28301 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
LoxP28301 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LoxP28301 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LoxP28301 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LoxP28301 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LoxP28301 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
LoxP28301 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LoxP28301 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
LoxP28301 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LoxP28301 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LoxP28301 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
LoxP28301 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
LoxP28301 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
LoxP28301 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LoxP28301 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LoxP28301 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LoxP28301 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LoxP28301 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
LoxP28301 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.22
LoxP28301 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
LoxP28301 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
LoxP28301 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
LoxP28301 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LoxP28301 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
LoxP28301 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
LoxP28301 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LoxP28301 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms