Protein–RNA interactions for Protein: P28235

Gja4, Gap junction alpha-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja4P28235 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gja4P28235 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gja4P28235 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gja4P28235 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gja4P28235 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gja4P28235 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gja4P28235 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gja4P28235 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gja4P28235 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gja4P28235 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gja4P28235 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gja4P28235 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gja4P28235 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gja4P28235 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gja4P28235 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gja4P28235 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gja4P28235 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gja4P28235 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gja4P28235 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gja4P28235 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gja4P28235 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gja4P28235 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gja4P28235 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gja4P28235 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gja4P28235 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gja4P28235 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gja4P28235 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gja4P28235 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gja4P28235 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gja4P28235 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gja4P28235 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gja4P28235 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gja4P28235 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gja4P28235 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gja4P28235 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gja4P28235 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gja4P28235 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gja4P28235 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gja4P28235 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gja4P28235 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gja4P28235 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gja4P28235 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gja4P28235 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gja4P28235 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gja4P28235 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gja4P28235 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gja4P28235 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gja4P28235 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gja4P28235 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gja4P28235 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gja4P28235 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gja4P28235 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gja4P28235 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gja4P28235 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gja4P28235 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gja4P28235 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gja4P28235 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gja4P28235 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gja4P28235 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gja4P28235 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gja4P28235 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gja4P28235 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gja4P28235 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gja4P28235 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gja4P28235 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gja4P28235 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gja4P28235 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gja4P28235 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Gja4P28235 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gja4P28235 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gja4P28235 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gja4P28235 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gja4P28235 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gja4P28235 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gja4P28235 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gja4P28235 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gja4P28235 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gja4P28235 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gja4P28235 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gja4P28235 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gja4P28235 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gja4P28235 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gja4P28235 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gja4P28235 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gja4P28235 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Gja4P28235 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gja4P28235 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Gja4P28235 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gja4P28235 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gja4P28235 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gja4P28235 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gja4P28235 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gja4P28235 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gja4P28235 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gja4P28235 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gja4P28235 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gja4P28235 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gja4P28235 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gja4P28235 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gja4P28235 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms