Protein–RNA interactions for Protein: P28229

Gjc1, Gap junction gamma-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjc1P28229 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gjc1P28229 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gjc1P28229 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gjc1P28229 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gjc1P28229 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gjc1P28229 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gjc1P28229 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gjc1P28229 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gjc1P28229 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gjc1P28229 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gjc1P28229 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Gjc1P28229 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gjc1P28229 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gjc1P28229 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gjc1P28229 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gjc1P28229 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gjc1P28229 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gjc1P28229 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gjc1P28229 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gjc1P28229 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gjc1P28229 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gjc1P28229 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gjc1P28229 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gjc1P28229 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gjc1P28229 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gjc1P28229 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gjc1P28229 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gjc1P28229 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gjc1P28229 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gjc1P28229 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gjc1P28229 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gjc1P28229 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gjc1P28229 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Gjc1P28229 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gjc1P28229 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gjc1P28229 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Gjc1P28229 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Gjc1P28229 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gjc1P28229 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gjc1P28229 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gjc1P28229 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gjc1P28229 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gjc1P28229 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gjc1P28229 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gjc1P28229 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gjc1P28229 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gjc1P28229 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gjc1P28229 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gjc1P28229 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gjc1P28229 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gjc1P28229 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gjc1P28229 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gjc1P28229 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gjc1P28229 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gjc1P28229 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gjc1P28229 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gjc1P28229 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gjc1P28229 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gjc1P28229 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gjc1P28229 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gjc1P28229 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gjc1P28229 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gjc1P28229 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gjc1P28229 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gjc1P28229 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gjc1P28229 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gjc1P28229 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gjc1P28229 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gjc1P28229 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gjc1P28229 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gjc1P28229 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gjc1P28229 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gjc1P28229 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gjc1P28229 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gjc1P28229 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gjc1P28229 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gjc1P28229 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gjc1P28229 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gjc1P28229 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gjc1P28229 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gjc1P28229 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gjc1P28229 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gjc1P28229 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gjc1P28229 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gjc1P28229 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gjc1P28229 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gjc1P28229 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gjc1P28229 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gjc1P28229 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gjc1P28229 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Gjc1P28229 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gjc1P28229 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gjc1P28229 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gjc1P28229 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gjc1P28229 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gjc1P28229 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gjc1P28229 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gjc1P28229 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gjc1P28229 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gjc1P28229 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms