Protein–RNA interactions for Protein: P27681

Gabrg3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit gamma-3, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabrg3P27681 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabrg3P27681 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabrg3P27681 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabrg3P27681 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabrg3P27681 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabrg3P27681 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabrg3P27681 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabrg3P27681 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabrg3P27681 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabrg3P27681 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabrg3P27681 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabrg3P27681 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabrg3P27681 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabrg3P27681 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabrg3P27681 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabrg3P27681 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabrg3P27681 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabrg3P27681 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabrg3P27681 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabrg3P27681 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabrg3P27681 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabrg3P27681 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabrg3P27681 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabrg3P27681 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabrg3P27681 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabrg3P27681 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabrg3P27681 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabrg3P27681 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabrg3P27681 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabrg3P27681 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabrg3P27681 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabrg3P27681 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabrg3P27681 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabrg3P27681 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabrg3P27681 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabrg3P27681 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabrg3P27681 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabrg3P27681 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabrg3P27681 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabrg3P27681 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabrg3P27681 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabrg3P27681 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabrg3P27681 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabrg3P27681 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabrg3P27681 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabrg3P27681 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabrg3P27681 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabrg3P27681 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabrg3P27681 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabrg3P27681 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabrg3P27681 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabrg3P27681 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabrg3P27681 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabrg3P27681 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabrg3P27681 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabrg3P27681 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabrg3P27681 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabrg3P27681 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabrg3P27681 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabrg3P27681 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabrg3P27681 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabrg3P27681 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabrg3P27681 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabrg3P27681 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabrg3P27681 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabrg3P27681 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabrg3P27681 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabrg3P27681 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabrg3P27681 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabrg3P27681 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabrg3P27681 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabrg3P27681 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabrg3P27681 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabrg3P27681 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabrg3P27681 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabrg3P27681 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabrg3P27681 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabrg3P27681 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabrg3P27681 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabrg3P27681 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabrg3P27681 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabrg3P27681 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabrg3P27681 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabrg3P27681 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabrg3P27681 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabrg3P27681 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabrg3P27681 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabrg3P27681 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabrg3P27681 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabrg3P27681 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabrg3P27681 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabrg3P27681 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabrg3P27681 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabrg3P27681 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabrg3P27681 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabrg3P27681 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabrg3P27681 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabrg3P27681 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabrg3P27681 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabrg3P27681 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms