Protein–RNA interactions for Protein: P27661

H2afx, Histone H2AX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afxP27661 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
H2afxP27661 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
H2afxP27661 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
H2afxP27661 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
H2afxP27661 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
H2afxP27661 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
H2afxP27661 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
H2afxP27661 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
H2afxP27661 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
H2afxP27661 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
H2afxP27661 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
H2afxP27661 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
H2afxP27661 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
H2afxP27661 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
H2afxP27661 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
H2afxP27661 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
H2afxP27661 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
H2afxP27661 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
H2afxP27661 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
H2afxP27661 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
H2afxP27661 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
H2afxP27661 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
H2afxP27661 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
H2afxP27661 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
H2afxP27661 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
H2afxP27661 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
H2afxP27661 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
H2afxP27661 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
H2afxP27661 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
H2afxP27661 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
H2afxP27661 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
H2afxP27661 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
H2afxP27661 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
H2afxP27661 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
H2afxP27661 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
H2afxP27661 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
H2afxP27661 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
H2afxP27661 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
H2afxP27661 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
H2afxP27661 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
H2afxP27661 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
H2afxP27661 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
H2afxP27661 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
H2afxP27661 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
H2afxP27661 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
H2afxP27661 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
H2afxP27661 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
H2afxP27661 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
H2afxP27661 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
H2afxP27661 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
H2afxP27661 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
H2afxP27661 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
H2afxP27661 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
H2afxP27661 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
H2afxP27661 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
H2afxP27661 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
H2afxP27661 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
H2afxP27661 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
H2afxP27661 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
H2afxP27661 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
H2afxP27661 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
H2afxP27661 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
H2afxP27661 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
H2afxP27661 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
H2afxP27661 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
H2afxP27661 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
H2afxP27661 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
H2afxP27661 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
H2afxP27661 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
H2afxP27661 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
H2afxP27661 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
H2afxP27661 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
H2afxP27661 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
H2afxP27661 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
H2afxP27661 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
H2afxP27661 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
H2afxP27661 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
H2afxP27661 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
H2afxP27661 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
H2afxP27661 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
H2afxP27661 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
H2afxP27661 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
H2afxP27661 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
H2afxP27661 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
H2afxP27661 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
H2afxP27661 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
H2afxP27661 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
H2afxP27661 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
H2afxP27661 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
H2afxP27661 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
H2afxP27661 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
H2afxP27661 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
H2afxP27661 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
H2afxP27661 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
H2afxP27661 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
H2afxP27661 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
H2afxP27661 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
H2afxP27661 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
H2afxP27661 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
H2afxP27661 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms