Protein–RNA interactions for Protein: P26361

Cftr, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CftrP26361 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CftrP26361 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CftrP26361 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
CftrP26361 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
CftrP26361 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CftrP26361 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CftrP26361 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CftrP26361 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
CftrP26361 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CftrP26361 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CftrP26361 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CftrP26361 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CftrP26361 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CftrP26361 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CftrP26361 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CftrP26361 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CftrP26361 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CftrP26361 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
CftrP26361 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
CftrP26361 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CftrP26361 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CftrP26361 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CftrP26361 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CftrP26361 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CftrP26361 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
CftrP26361 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CftrP26361 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CftrP26361 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CftrP26361 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CftrP26361 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CftrP26361 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CftrP26361 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CftrP26361 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CftrP26361 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CftrP26361 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CftrP26361 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CftrP26361 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CftrP26361 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CftrP26361 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CftrP26361 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CftrP26361 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CftrP26361 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CftrP26361 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CftrP26361 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CftrP26361 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CftrP26361 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CftrP26361 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CftrP26361 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CftrP26361 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CftrP26361 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CftrP26361 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
CftrP26361 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CftrP26361 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CftrP26361 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CftrP26361 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CftrP26361 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CftrP26361 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CftrP26361 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CftrP26361 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CftrP26361 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CftrP26361 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CftrP26361 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CftrP26361 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CftrP26361 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CftrP26361 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CftrP26361 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CftrP26361 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CftrP26361 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CftrP26361 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CftrP26361 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CftrP26361 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CftrP26361 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CftrP26361 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
CftrP26361 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
CftrP26361 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
CftrP26361 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CftrP26361 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CftrP26361 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CftrP26361 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CftrP26361 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
CftrP26361 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CftrP26361 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CftrP26361 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CftrP26361 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CftrP26361 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CftrP26361 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CftrP26361 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CftrP26361 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CftrP26361 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CftrP26361 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CftrP26361 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CftrP26361 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CftrP26361 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CftrP26361 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CftrP26361 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CftrP26361 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CftrP26361 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CftrP26361 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CftrP26361 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CftrP26361 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms