Protein–RNA interactions for Protein: P24161

Cd247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, mousemouse

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd247P24161 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cd247P24161 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cd247P24161 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cd247P24161 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cd247P24161 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cd247P24161 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cd247P24161 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cd247P24161 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cd247P24161 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cd247P24161 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cd247P24161 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Cd247P24161 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cd247P24161 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Cd247P24161 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cd247P24161 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cd247P24161 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cd247P24161 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Cd247P24161 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cd247P24161 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cd247P24161 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cd247P24161 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cd247P24161 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cd247P24161 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cd247P24161 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cd247P24161 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cd247P24161 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cd247P24161 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Cd247P24161 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cd247P24161 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cd247P24161 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cd247P24161 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cd247P24161 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cd247P24161 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Cd247P24161 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cd247P24161 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cd247P24161 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cd247P24161 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cd247P24161 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cd247P24161 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cd247P24161 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cd247P24161 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cd247P24161 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cd247P24161 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cd247P24161 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cd247P24161 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cd247P24161 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cd247P24161 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cd247P24161 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cd247P24161 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cd247P24161 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Cd247P24161 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cd247P24161 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cd247P24161 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cd247P24161 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cd247P24161 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cd247P24161 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cd247P24161 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cd247P24161 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cd247P24161 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cd247P24161 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cd247P24161 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cd247P24161 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cd247P24161 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cd247P24161 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cd247P24161 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cd247P24161 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cd247P24161 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cd247P24161 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cd247P24161 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cd247P24161 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cd247P24161 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cd247P24161 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cd247P24161 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cd247P24161 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cd247P24161 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cd247P24161 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cd247P24161 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cd247P24161 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cd247P24161 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cd247P24161 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cd247P24161 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cd247P24161 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cd247P24161 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cd247P24161 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cd247P24161 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cd247P24161 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cd247P24161 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cd247P24161 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cd247P24161 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cd247P24161 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cd247P24161 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cd247P24161 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cd247P24161 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cd247P24161 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cd247P24161 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cd247P24161 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cd247P24161 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cd247P24161 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Cd247P24161 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cd247P24161 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms