Protein–RNA interactions for Protein: P23818

Gria1, Glutamate receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gria1P23818 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gria1P23818 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gria1P23818 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gria1P23818 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gria1P23818 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gria1P23818 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gria1P23818 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gria1P23818 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gria1P23818 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gria1P23818 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gria1P23818 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gria1P23818 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gria1P23818 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gria1P23818 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gria1P23818 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gria1P23818 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gria1P23818 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gria1P23818 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gria1P23818 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gria1P23818 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gria1P23818 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gria1P23818 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gria1P23818 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gria1P23818 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gria1P23818 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gria1P23818 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gria1P23818 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gria1P23818 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gria1P23818 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gria1P23818 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gria1P23818 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gria1P23818 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gria1P23818 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gria1P23818 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gria1P23818 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gria1P23818 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gria1P23818 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gria1P23818 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gria1P23818 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gria1P23818 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gria1P23818 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gria1P23818 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gria1P23818 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gria1P23818 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gria1P23818 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gria1P23818 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gria1P23818 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gria1P23818 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gria1P23818 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gria1P23818 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gria1P23818 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gria1P23818 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gria1P23818 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gria1P23818 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gria1P23818 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gria1P23818 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gria1P23818 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gria1P23818 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gria1P23818 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gria1P23818 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gria1P23818 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gria1P23818 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gria1P23818 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gria1P23818 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gria1P23818 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gria1P23818 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gria1P23818 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gria1P23818 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gria1P23818 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gria1P23818 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gria1P23818 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gria1P23818 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gria1P23818 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gria1P23818 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gria1P23818 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gria1P23818 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gria1P23818 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gria1P23818 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gria1P23818 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gria1P23818 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gria1P23818 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gria1P23818 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gria1P23818 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gria1P23818 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gria1P23818 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gria1P23818 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gria1P23818 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gria1P23818 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gria1P23818 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gria1P23818 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gria1P23818 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gria1P23818 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gria1P23818 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gria1P23818 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gria1P23818 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gria1P23818 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gria1P23818 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gria1P23818 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gria1P23818 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gria1P23818 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms