Protein–RNA interactions for Protein: P23607

Zfa, Zinc finger autosomal protein, mousemouse

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZfaP23607 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZfaP23607 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZfaP23607 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZfaP23607 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZfaP23607 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZfaP23607 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZfaP23607 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZfaP23607 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZfaP23607 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZfaP23607 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZfaP23607 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZfaP23607 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZfaP23607 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZfaP23607 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZfaP23607 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZfaP23607 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZfaP23607 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZfaP23607 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZfaP23607 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZfaP23607 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZfaP23607 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZfaP23607 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZfaP23607 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZfaP23607 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZfaP23607 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZfaP23607 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZfaP23607 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZfaP23607 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZfaP23607 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZfaP23607 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZfaP23607 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZfaP23607 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZfaP23607 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZfaP23607 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZfaP23607 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ZfaP23607 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZfaP23607 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZfaP23607 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZfaP23607 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZfaP23607 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZfaP23607 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZfaP23607 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZfaP23607 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZfaP23607 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZfaP23607 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZfaP23607 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZfaP23607 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ZfaP23607 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ZfaP23607 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ZfaP23607 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ZfaP23607 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ZfaP23607 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ZfaP23607 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ZfaP23607 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ZfaP23607 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ZfaP23607 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZfaP23607 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZfaP23607 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZfaP23607 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ZfaP23607 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZfaP23607 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZfaP23607 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZfaP23607 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZfaP23607 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZfaP23607 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZfaP23607 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZfaP23607 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZfaP23607 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZfaP23607 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZfaP23607 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZfaP23607 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZfaP23607 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZfaP23607 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZfaP23607 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZfaP23607 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZfaP23607 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZfaP23607 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZfaP23607 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZfaP23607 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZfaP23607 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZfaP23607 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZfaP23607 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZfaP23607 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZfaP23607 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZfaP23607 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZfaP23607 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZfaP23607 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZfaP23607 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZfaP23607 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZfaP23607 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZfaP23607 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ZfaP23607 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZfaP23607 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZfaP23607 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZfaP23607 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZfaP23607 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ZfaP23607 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZfaP23607 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZfaP23607 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZfaP23607 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms