Protein–RNA interactions for Protein: P23591

Tsta3, GDP-L-fucose synthase, mousemouse

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsta3P23591 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tsta3P23591 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tsta3P23591 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tsta3P23591 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tsta3P23591 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tsta3P23591 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tsta3P23591 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tsta3P23591 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tsta3P23591 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tsta3P23591 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tsta3P23591 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Tsta3P23591 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tsta3P23591 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tsta3P23591 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tsta3P23591 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tsta3P23591 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Tsta3P23591 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tsta3P23591 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tsta3P23591 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tsta3P23591 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tsta3P23591 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tsta3P23591 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tsta3P23591 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tsta3P23591 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tsta3P23591 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tsta3P23591 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Tsta3P23591 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Tsta3P23591 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Tsta3P23591 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tsta3P23591 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tsta3P23591 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tsta3P23591 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tsta3P23591 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tsta3P23591 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tsta3P23591 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tsta3P23591 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tsta3P23591 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tsta3P23591 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tsta3P23591 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tsta3P23591 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tsta3P23591 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tsta3P23591 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tsta3P23591 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tsta3P23591 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tsta3P23591 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tsta3P23591 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tsta3P23591 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tsta3P23591 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tsta3P23591 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tsta3P23591 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tsta3P23591 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tsta3P23591 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tsta3P23591 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tsta3P23591 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tsta3P23591 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tsta3P23591 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tsta3P23591 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tsta3P23591 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tsta3P23591 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tsta3P23591 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tsta3P23591 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tsta3P23591 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tsta3P23591 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tsta3P23591 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tsta3P23591 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tsta3P23591 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tsta3P23591 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tsta3P23591 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tsta3P23591 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tsta3P23591 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tsta3P23591 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tsta3P23591 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tsta3P23591 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tsta3P23591 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tsta3P23591 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tsta3P23591 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tsta3P23591 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tsta3P23591 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tsta3P23591 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tsta3P23591 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tsta3P23591 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tsta3P23591 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tsta3P23591 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tsta3P23591 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tsta3P23591 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tsta3P23591 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tsta3P23591 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tsta3P23591 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tsta3P23591 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tsta3P23591 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tsta3P23591 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tsta3P23591 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tsta3P23591 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tsta3P23591 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tsta3P23591 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tsta3P23591 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tsta3P23591 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tsta3P23591 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tsta3P23591 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tsta3P23591 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms