Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ggta1P23336 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ggta1P23336 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ggta1P23336 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ggta1P23336 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ggta1P23336 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ggta1P23336 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ggta1P23336 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ggta1P23336 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ggta1P23336 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ggta1P23336 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ggta1P23336 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ggta1P23336 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ggta1P23336 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ggta1P23336 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ggta1P23336 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ggta1P23336 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ggta1P23336 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ggta1P23336 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ggta1P23336 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ggta1P23336 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ggta1P23336 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ggta1P23336 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ggta1P23336 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ggta1P23336 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ggta1P23336 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ggta1P23336 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ggta1P23336 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ggta1P23336 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ggta1P23336 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ggta1P23336 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ggta1P23336 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ggta1P23336 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ggta1P23336 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ggta1P23336 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ggta1P23336 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ggta1P23336 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ggta1P23336 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ggta1P23336 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ggta1P23336 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ggta1P23336 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ggta1P23336 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ggta1P23336 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ggta1P23336 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ggta1P23336 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ggta1P23336 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ggta1P23336 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ggta1P23336 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ggta1P23336 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ggta1P23336 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ggta1P23336 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ggta1P23336 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ggta1P23336 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ggta1P23336 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ggta1P23336 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ggta1P23336 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ggta1P23336 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ggta1P23336 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ggta1P23336 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ggta1P23336 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ggta1P23336 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ggta1P23336 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ggta1P23336 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ggta1P23336 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ggta1P23336 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ggta1P23336 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ggta1P23336 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ggta1P23336 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ggta1P23336 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ggta1P23336 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ggta1P23336 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ggta1P23336 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ggta1P23336 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ggta1P23336 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ggta1P23336 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ggta1P23336 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ggta1P23336 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ggta1P23336 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ggta1P23336 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ggta1P23336 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ggta1P23336 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ggta1P23336 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ggta1P23336 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ggta1P23336 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ggta1P23336 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ggta1P23336 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ggta1P23336 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ggta1P23336 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ggta1P23336 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ggta1P23336 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ggta1P23336 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ggta1P23336 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ggta1P23336 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ggta1P23336 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ggta1P23336 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ggta1P23336 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ggta1P23336 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ggta1P23336 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ggta1P23336 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ggta1P23336 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.5 ms