Protein–RNA interactions for Protein: P21952

Pou3f1, POU domain, class 3, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou3f1P21952 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pou3f1P21952 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pou3f1P21952 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pou3f1P21952 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pou3f1P21952 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pou3f1P21952 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Pou3f1P21952 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pou3f1P21952 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pou3f1P21952 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pou3f1P21952 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pou3f1P21952 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Pou3f1P21952 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pou3f1P21952 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pou3f1P21952 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pou3f1P21952 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pou3f1P21952 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pou3f1P21952 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pou3f1P21952 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pou3f1P21952 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pou3f1P21952 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pou3f1P21952 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pou3f1P21952 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pou3f1P21952 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pou3f1P21952 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pou3f1P21952 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pou3f1P21952 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pou3f1P21952 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pou3f1P21952 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pou3f1P21952 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pou3f1P21952 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pou3f1P21952 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pou3f1P21952 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pou3f1P21952 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pou3f1P21952 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pou3f1P21952 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pou3f1P21952 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pou3f1P21952 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pou3f1P21952 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pou3f1P21952 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pou3f1P21952 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pou3f1P21952 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pou3f1P21952 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Pou3f1P21952 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pou3f1P21952 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pou3f1P21952 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pou3f1P21952 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pou3f1P21952 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pou3f1P21952 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pou3f1P21952 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pou3f1P21952 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pou3f1P21952 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pou3f1P21952 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pou3f1P21952 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pou3f1P21952 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pou3f1P21952 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pou3f1P21952 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pou3f1P21952 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pou3f1P21952 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pou3f1P21952 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pou3f1P21952 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pou3f1P21952 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pou3f1P21952 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pou3f1P21952 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Pou3f1P21952 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pou3f1P21952 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pou3f1P21952 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pou3f1P21952 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pou3f1P21952 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pou3f1P21952 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pou3f1P21952 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pou3f1P21952 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pou3f1P21952 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pou3f1P21952 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pou3f1P21952 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pou3f1P21952 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pou3f1P21952 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pou3f1P21952 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pou3f1P21952 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pou3f1P21952 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pou3f1P21952 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pou3f1P21952 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pou3f1P21952 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pou3f1P21952 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pou3f1P21952 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pou3f1P21952 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pou3f1P21952 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pou3f1P21952 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pou3f1P21952 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pou3f1P21952 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pou3f1P21952 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Pou3f1P21952 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pou3f1P21952 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Pou3f1P21952 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pou3f1P21952 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Pou3f1P21952 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pou3f1P21952 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pou3f1P21952 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pou3f1P21952 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pou3f1P21952 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pou3f1P21952 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms