Protein–RNA interactions for Protein: P20352

F3, Tissue factor, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F3P20352 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
F3P20352 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
F3P20352 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
F3P20352 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
F3P20352 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
F3P20352 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
F3P20352 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
F3P20352 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
F3P20352 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
F3P20352 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
F3P20352 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
F3P20352 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
F3P20352 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
F3P20352 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
F3P20352 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
F3P20352 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
F3P20352 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
F3P20352 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
F3P20352 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
F3P20352 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
F3P20352 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
F3P20352 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
F3P20352 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
F3P20352 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
F3P20352 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
F3P20352 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
F3P20352 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
F3P20352 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
F3P20352 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
F3P20352 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
F3P20352 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
F3P20352 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
F3P20352 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
F3P20352 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
F3P20352 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
F3P20352 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
F3P20352 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
F3P20352 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
F3P20352 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
F3P20352 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
F3P20352 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
F3P20352 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
F3P20352 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
F3P20352 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
F3P20352 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
F3P20352 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
F3P20352 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
F3P20352 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
F3P20352 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
F3P20352 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
F3P20352 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
F3P20352 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
F3P20352 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
F3P20352 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
F3P20352 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
F3P20352 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
F3P20352 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
F3P20352 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
F3P20352 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
F3P20352 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
F3P20352 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
F3P20352 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
F3P20352 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
F3P20352 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
F3P20352 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
F3P20352 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
F3P20352 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
F3P20352 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
F3P20352 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
F3P20352 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
F3P20352 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
F3P20352 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
F3P20352 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
F3P20352 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
F3P20352 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
F3P20352 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
F3P20352 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
F3P20352 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
F3P20352 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
F3P20352 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
F3P20352 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
F3P20352 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
F3P20352 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
F3P20352 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
F3P20352 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
F3P20352 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
F3P20352 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
F3P20352 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
F3P20352 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
F3P20352 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
F3P20352 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
F3P20352 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
F3P20352 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
F3P20352 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
F3P20352 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
F3P20352 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
F3P20352 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
F3P20352 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
F3P20352 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
F3P20352 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.6 ms