Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
P20040 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P20040 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P20040 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P20040 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P20040 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
P20040 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P20040 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P20040 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P20040 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P20040 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P20040 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
P20040 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P20040 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P20040 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P20040 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P20040 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P20040 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P20040 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P20040 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P20040 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P20040 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P20040 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P20040 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
P20040 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P20040 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
P20040 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
P20040 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
P20040 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
P20040 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.06
P20040 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.06
P20040 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
P20040 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
P20040 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
P20040 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
P20040 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P20040 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P20040 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P20040 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P20040 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P20040 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P20040 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P20040 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P20040 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P20040 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P20040 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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P20040 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P20040 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P20040 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P20040 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P20040 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P20040 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P20040 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P20040 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P20040 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P20040 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P20040 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P20040 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P20040 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P20040 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P20040 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P20040 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P20040 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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P20040 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P20040 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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P20040 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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P20040 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P20040 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P20040 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P20040 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P20040 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P20040 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P20040 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P20040 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P20040 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P20040 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P20040 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P20040 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P20040 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P20040 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P20040 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P20040 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P20040 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P20040 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P20040 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P20040 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P20040 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P20040 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P20040 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P20040 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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