Protein–RNA interactions for Protein: P19426

Nelfe, Negative elongation factor E, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NelfeP19426 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NelfeP19426 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NelfeP19426 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NelfeP19426 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NelfeP19426 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NelfeP19426 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NelfeP19426 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NelfeP19426 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NelfeP19426 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NelfeP19426 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NelfeP19426 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NelfeP19426 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NelfeP19426 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NelfeP19426 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NelfeP19426 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NelfeP19426 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NelfeP19426 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NelfeP19426 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NelfeP19426 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NelfeP19426 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NelfeP19426 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NelfeP19426 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NelfeP19426 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NelfeP19426 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NelfeP19426 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NelfeP19426 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NelfeP19426 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NelfeP19426 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NelfeP19426 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NelfeP19426 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NelfeP19426 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NelfeP19426 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NelfeP19426 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NelfeP19426 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NelfeP19426 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NelfeP19426 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NelfeP19426 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NelfeP19426 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NelfeP19426 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NelfeP19426 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NelfeP19426 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NelfeP19426 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NelfeP19426 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NelfeP19426 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NelfeP19426 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NelfeP19426 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NelfeP19426 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NelfeP19426 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NelfeP19426 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NelfeP19426 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NelfeP19426 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NelfeP19426 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NelfeP19426 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NelfeP19426 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NelfeP19426 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NelfeP19426 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NelfeP19426 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NelfeP19426 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NelfeP19426 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NelfeP19426 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NelfeP19426 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NelfeP19426 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NelfeP19426 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NelfeP19426 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NelfeP19426 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NelfeP19426 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NelfeP19426 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NelfeP19426 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NelfeP19426 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NelfeP19426 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NelfeP19426 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NelfeP19426 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NelfeP19426 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NelfeP19426 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NelfeP19426 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NelfeP19426 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NelfeP19426 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NelfeP19426 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NelfeP19426 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NelfeP19426 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NelfeP19426 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NelfeP19426 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NelfeP19426 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NelfeP19426 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NelfeP19426 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NelfeP19426 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NelfeP19426 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NelfeP19426 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NelfeP19426 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NelfeP19426 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NelfeP19426 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NelfeP19426 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NelfeP19426 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NelfeP19426 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NelfeP19426 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NelfeP19426 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NelfeP19426 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NelfeP19426 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NelfeP19426 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NelfeP19426 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms