Protein–RNA interactions for Protein: P19182

Ifrd1, Interferon-related developmental regulator 1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifrd1P19182 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ifrd1P19182 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ifrd1P19182 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ifrd1P19182 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ifrd1P19182 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ifrd1P19182 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ifrd1P19182 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ifrd1P19182 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ifrd1P19182 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ifrd1P19182 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ifrd1P19182 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ifrd1P19182 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ifrd1P19182 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Ifrd1P19182 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ifrd1P19182 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ifrd1P19182 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ifrd1P19182 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ifrd1P19182 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ifrd1P19182 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ifrd1P19182 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ifrd1P19182 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ifrd1P19182 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ifrd1P19182 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ifrd1P19182 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ifrd1P19182 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ifrd1P19182 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ifrd1P19182 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ifrd1P19182 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ifrd1P19182 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ifrd1P19182 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ifrd1P19182 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ifrd1P19182 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ifrd1P19182 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ifrd1P19182 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ifrd1P19182 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ifrd1P19182 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ifrd1P19182 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ifrd1P19182 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ifrd1P19182 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ifrd1P19182 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ifrd1P19182 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ifrd1P19182 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ifrd1P19182 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ifrd1P19182 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ifrd1P19182 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ifrd1P19182 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ifrd1P19182 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ifrd1P19182 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ifrd1P19182 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ifrd1P19182 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ifrd1P19182 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ifrd1P19182 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ifrd1P19182 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ifrd1P19182 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ifrd1P19182 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ifrd1P19182 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ifrd1P19182 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ifrd1P19182 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ifrd1P19182 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ifrd1P19182 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ifrd1P19182 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ifrd1P19182 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ifrd1P19182 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ifrd1P19182 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ifrd1P19182 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ifrd1P19182 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ifrd1P19182 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ifrd1P19182 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ifrd1P19182 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ifrd1P19182 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ifrd1P19182 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ifrd1P19182 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ifrd1P19182 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ifrd1P19182 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ifrd1P19182 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ifrd1P19182 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ifrd1P19182 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ifrd1P19182 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ifrd1P19182 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ifrd1P19182 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ifrd1P19182 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ifrd1P19182 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ifrd1P19182 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ifrd1P19182 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ifrd1P19182 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ifrd1P19182 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ifrd1P19182 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ifrd1P19182 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ifrd1P19182 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ifrd1P19182 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ifrd1P19182 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ifrd1P19182 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ifrd1P19182 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ifrd1P19182 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ifrd1P19182 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ifrd1P19182 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ifrd1P19182 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ifrd1P19182 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ifrd1P19182 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ifrd1P19182 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms