Protein–RNA interactions for Protein: P19123

Tnnc1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc1P19123 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnnc1P19123 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnnc1P19123 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnnc1P19123 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnnc1P19123 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnnc1P19123 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnnc1P19123 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnnc1P19123 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnnc1P19123 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnnc1P19123 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnnc1P19123 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnnc1P19123 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnnc1P19123 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnnc1P19123 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnnc1P19123 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnnc1P19123 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnnc1P19123 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnnc1P19123 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnnc1P19123 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnnc1P19123 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnnc1P19123 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnnc1P19123 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnnc1P19123 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnnc1P19123 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnnc1P19123 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnnc1P19123 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnnc1P19123 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnnc1P19123 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnnc1P19123 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnnc1P19123 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnnc1P19123 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnnc1P19123 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnnc1P19123 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnnc1P19123 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnnc1P19123 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnnc1P19123 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnnc1P19123 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnnc1P19123 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnnc1P19123 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnnc1P19123 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnnc1P19123 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnnc1P19123 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnnc1P19123 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnnc1P19123 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnnc1P19123 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnnc1P19123 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnnc1P19123 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnnc1P19123 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnnc1P19123 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnnc1P19123 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnnc1P19123 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnnc1P19123 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnnc1P19123 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnnc1P19123 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnnc1P19123 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnnc1P19123 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnnc1P19123 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnnc1P19123 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnnc1P19123 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnnc1P19123 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnnc1P19123 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnnc1P19123 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnnc1P19123 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnnc1P19123 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnnc1P19123 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnnc1P19123 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnnc1P19123 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnnc1P19123 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnnc1P19123 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnnc1P19123 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnnc1P19123 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnnc1P19123 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnnc1P19123 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnnc1P19123 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnnc1P19123 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnnc1P19123 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnnc1P19123 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnnc1P19123 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnnc1P19123 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnnc1P19123 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tnnc1P19123 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tnnc1P19123 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tnnc1P19123 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tnnc1P19123 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tnnc1P19123 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tnnc1P19123 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tnnc1P19123 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tnnc1P19123 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnnc1P19123 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnnc1P19123 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnnc1P19123 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnnc1P19123 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnnc1P19123 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnnc1P19123 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnnc1P19123 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnnc1P19123 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnnc1P19123 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnnc1P19123 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnnc1P19123 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnnc1P19123 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms