Protein–RNA interactions for Protein: P18654

Rps6ka3, Ribosomal protein S6 kinase alpha-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 740 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka3P18654 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rps6ka3P18654 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rps6ka3P18654 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rps6ka3P18654 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rps6ka3P18654 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rps6ka3P18654 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rps6ka3P18654 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rps6ka3P18654 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rps6ka3P18654 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rps6ka3P18654 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rps6ka3P18654 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rps6ka3P18654 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rps6ka3P18654 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rps6ka3P18654 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rps6ka3P18654 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rps6ka3P18654 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rps6ka3P18654 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rps6ka3P18654 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rps6ka3P18654 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rps6ka3P18654 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rps6ka3P18654 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rps6ka3P18654 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rps6ka3P18654 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rps6ka3P18654 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rps6ka3P18654 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rps6ka3P18654 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rps6ka3P18654 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rps6ka3P18654 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rps6ka3P18654 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rps6ka3P18654 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rps6ka3P18654 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rps6ka3P18654 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rps6ka3P18654 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rps6ka3P18654 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rps6ka3P18654 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rps6ka3P18654 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rps6ka3P18654 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rps6ka3P18654 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rps6ka3P18654 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rps6ka3P18654 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rps6ka3P18654 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rps6ka3P18654 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rps6ka3P18654 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rps6ka3P18654 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rps6ka3P18654 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rps6ka3P18654 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rps6ka3P18654 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rps6ka3P18654 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rps6ka3P18654 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rps6ka3P18654 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rps6ka3P18654 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rps6ka3P18654 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rps6ka3P18654 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rps6ka3P18654 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rps6ka3P18654 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rps6ka3P18654 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rps6ka3P18654 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rps6ka3P18654 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rps6ka3P18654 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rps6ka3P18654 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rps6ka3P18654 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rps6ka3P18654 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rps6ka3P18654 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rps6ka3P18654 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rps6ka3P18654 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rps6ka3P18654 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rps6ka3P18654 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rps6ka3P18654 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rps6ka3P18654 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rps6ka3P18654 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rps6ka3P18654 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rps6ka3P18654 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rps6ka3P18654 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rps6ka3P18654 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rps6ka3P18654 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rps6ka3P18654 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rps6ka3P18654 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rps6ka3P18654 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rps6ka3P18654 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rps6ka3P18654 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rps6ka3P18654 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rps6ka3P18654 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rps6ka3P18654 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rps6ka3P18654 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rps6ka3P18654 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rps6ka3P18654 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rps6ka3P18654 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rps6ka3P18654 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rps6ka3P18654 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rps6ka3P18654 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rps6ka3P18654 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rps6ka3P18654 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rps6ka3P18654 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rps6ka3P18654 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rps6ka3P18654 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rps6ka3P18654 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rps6ka3P18654 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rps6ka3P18654 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rps6ka3P18654 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rps6ka3P18654 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms