Protein–RNA interactions for Protein: P18653

Rps6ka1, Ribosomal protein S6 kinase alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka1P18653 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rps6ka1P18653 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rps6ka1P18653 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Rps6ka1P18653 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rps6ka1P18653 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rps6ka1P18653 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rps6ka1P18653 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rps6ka1P18653 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rps6ka1P18653 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rps6ka1P18653 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rps6ka1P18653 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rps6ka1P18653 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rps6ka1P18653 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rps6ka1P18653 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rps6ka1P18653 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rps6ka1P18653 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rps6ka1P18653 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rps6ka1P18653 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rps6ka1P18653 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rps6ka1P18653 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rps6ka1P18653 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rps6ka1P18653 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rps6ka1P18653 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rps6ka1P18653 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rps6ka1P18653 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rps6ka1P18653 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rps6ka1P18653 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rps6ka1P18653 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rps6ka1P18653 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rps6ka1P18653 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rps6ka1P18653 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rps6ka1P18653 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rps6ka1P18653 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Rps6ka1P18653 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Rps6ka1P18653 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rps6ka1P18653 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rps6ka1P18653 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rps6ka1P18653 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rps6ka1P18653 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rps6ka1P18653 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rps6ka1P18653 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rps6ka1P18653 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Rps6ka1P18653 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rps6ka1P18653 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rps6ka1P18653 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rps6ka1P18653 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rps6ka1P18653 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rps6ka1P18653 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Rps6ka1P18653 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rps6ka1P18653 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rps6ka1P18653 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rps6ka1P18653 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rps6ka1P18653 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rps6ka1P18653 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rps6ka1P18653 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rps6ka1P18653 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rps6ka1P18653 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rps6ka1P18653 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rps6ka1P18653 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rps6ka1P18653 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rps6ka1P18653 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rps6ka1P18653 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rps6ka1P18653 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Rps6ka1P18653 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rps6ka1P18653 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rps6ka1P18653 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rps6ka1P18653 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rps6ka1P18653 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rps6ka1P18653 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rps6ka1P18653 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rps6ka1P18653 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Rps6ka1P18653 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Rps6ka1P18653 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rps6ka1P18653 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rps6ka1P18653 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rps6ka1P18653 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rps6ka1P18653 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rps6ka1P18653 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rps6ka1P18653 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rps6ka1P18653 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rps6ka1P18653 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rps6ka1P18653 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rps6ka1P18653 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rps6ka1P18653 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rps6ka1P18653 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rps6ka1P18653 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Rps6ka1P18653 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rps6ka1P18653 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rps6ka1P18653 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rps6ka1P18653 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rps6ka1P18653 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rps6ka1P18653 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rps6ka1P18653 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rps6ka1P18653 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rps6ka1P18653 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Rps6ka1P18653 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rps6ka1P18653 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rps6ka1P18653 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rps6ka1P18653 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rps6ka1P18653 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms