Protein–RNA interactions for Protein: P18530

Ig heavy chain V region 7-39, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18530 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P18530 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P18530 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P18530 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
P18530 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P18530 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
P18530 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P18530 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
P18530 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P18530 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P18530 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P18530 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P18530 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
P18530 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P18530 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P18530 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
P18530 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P18530 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P18530 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P18530 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P18530 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P18530 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P18530 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P18530 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P18530 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P18530 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
P18530 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
P18530 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P18530 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P18530 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P18530 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
P18530 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P18530 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P18530 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
P18530 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P18530 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P18530 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P18530 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P18530 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
P18530 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P18530 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
P18530 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P18530 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P18530 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P18530 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P18530 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
P18530 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
P18530 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P18530 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P18530 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P18530 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
P18530 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
P18530 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P18530 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P18530 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
P18530 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P18530 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P18530 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
P18530 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
P18530 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P18530 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P18530 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P18530 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P18530 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P18530 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P18530 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P18530 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P18530 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P18530 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P18530 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
P18530 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
P18530 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
P18530 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P18530 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P18530 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P18530 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P18530 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P18530 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P18530 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P18530 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P18530 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
P18530 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P18530 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P18530 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P18530 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
P18530 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
P18530 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P18530 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P18530 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P18530 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P18530 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P18530 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P18530 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
P18530 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P18530 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P18530 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
P18530 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
P18530 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
P18530 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P18530 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.9 ms