Protein–RNA interactions for Protein: P15919

Rag1, V(D)J recombination-activating protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rag1P15919 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rag1P15919 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rag1P15919 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rag1P15919 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rag1P15919 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rag1P15919 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rag1P15919 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rag1P15919 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rag1P15919 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rag1P15919 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rag1P15919 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rag1P15919 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rag1P15919 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rag1P15919 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rag1P15919 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rag1P15919 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rag1P15919 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rag1P15919 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rag1P15919 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rag1P15919 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rag1P15919 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Rag1P15919 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rag1P15919 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rag1P15919 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rag1P15919 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Rag1P15919 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rag1P15919 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rag1P15919 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rag1P15919 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rag1P15919 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rag1P15919 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rag1P15919 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rag1P15919 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rag1P15919 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rag1P15919 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rag1P15919 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rag1P15919 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rag1P15919 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rag1P15919 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rag1P15919 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rag1P15919 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rag1P15919 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rag1P15919 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rag1P15919 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rag1P15919 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rag1P15919 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rag1P15919 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rag1P15919 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rag1P15919 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rag1P15919 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rag1P15919 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rag1P15919 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rag1P15919 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rag1P15919 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rag1P15919 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rag1P15919 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rag1P15919 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rag1P15919 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Rag1P15919 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rag1P15919 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rag1P15919 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rag1P15919 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rag1P15919 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rag1P15919 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rag1P15919 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rag1P15919 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rag1P15919 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rag1P15919 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rag1P15919 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rag1P15919 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rag1P15919 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rag1P15919 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rag1P15919 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rag1P15919 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rag1P15919 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rag1P15919 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rag1P15919 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rag1P15919 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rag1P15919 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rag1P15919 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rag1P15919 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rag1P15919 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rag1P15919 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rag1P15919 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rag1P15919 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rag1P15919 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rag1P15919 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rag1P15919 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rag1P15919 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rag1P15919 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rag1P15919 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rag1P15919 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rag1P15919 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rag1P15919 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rag1P15919 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Rag1P15919 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rag1P15919 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rag1P15919 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rag1P15919 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rag1P15919 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms