Protein–RNA interactions for Protein: P12960

Cntn1, Contactin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,020 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn1P12960 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cntn1P12960 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cntn1P12960 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cntn1P12960 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cntn1P12960 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cntn1P12960 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cntn1P12960 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cntn1P12960 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cntn1P12960 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cntn1P12960 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cntn1P12960 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cntn1P12960 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cntn1P12960 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cntn1P12960 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cntn1P12960 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cntn1P12960 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cntn1P12960 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cntn1P12960 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cntn1P12960 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cntn1P12960 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cntn1P12960 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cntn1P12960 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cntn1P12960 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cntn1P12960 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cntn1P12960 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cntn1P12960 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cntn1P12960 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cntn1P12960 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cntn1P12960 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cntn1P12960 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cntn1P12960 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cntn1P12960 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cntn1P12960 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cntn1P12960 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cntn1P12960 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cntn1P12960 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cntn1P12960 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cntn1P12960 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cntn1P12960 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cntn1P12960 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cntn1P12960 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cntn1P12960 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cntn1P12960 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cntn1P12960 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cntn1P12960 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cntn1P12960 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cntn1P12960 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cntn1P12960 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cntn1P12960 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cntn1P12960 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cntn1P12960 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cntn1P12960 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cntn1P12960 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cntn1P12960 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cntn1P12960 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cntn1P12960 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cntn1P12960 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cntn1P12960 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cntn1P12960 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cntn1P12960 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cntn1P12960 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cntn1P12960 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cntn1P12960 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cntn1P12960 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cntn1P12960 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cntn1P12960 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cntn1P12960 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cntn1P12960 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cntn1P12960 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cntn1P12960 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cntn1P12960 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cntn1P12960 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cntn1P12960 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cntn1P12960 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cntn1P12960 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cntn1P12960 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cntn1P12960 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cntn1P12960 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cntn1P12960 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cntn1P12960 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cntn1P12960 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cntn1P12960 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cntn1P12960 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cntn1P12960 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cntn1P12960 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cntn1P12960 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cntn1P12960 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cntn1P12960 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cntn1P12960 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cntn1P12960 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cntn1P12960 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cntn1P12960 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cntn1P12960 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cntn1P12960 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cntn1P12960 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cntn1P12960 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cntn1P12960 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cntn1P12960 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cntn1P12960 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cntn1P12960 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms