Protein–RNA interactions for Protein: P12813

Nr4a1, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr4a1P12813 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nr4a1P12813 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nr4a1P12813 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nr4a1P12813 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nr4a1P12813 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nr4a1P12813 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nr4a1P12813 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nr4a1P12813 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nr4a1P12813 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nr4a1P12813 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nr4a1P12813 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nr4a1P12813 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nr4a1P12813 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nr4a1P12813 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nr4a1P12813 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nr4a1P12813 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nr4a1P12813 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nr4a1P12813 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nr4a1P12813 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nr4a1P12813 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nr4a1P12813 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nr4a1P12813 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nr4a1P12813 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nr4a1P12813 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nr4a1P12813 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nr4a1P12813 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nr4a1P12813 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nr4a1P12813 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nr4a1P12813 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nr4a1P12813 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nr4a1P12813 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nr4a1P12813 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nr4a1P12813 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nr4a1P12813 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nr4a1P12813 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nr4a1P12813 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nr4a1P12813 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nr4a1P12813 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nr4a1P12813 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nr4a1P12813 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nr4a1P12813 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nr4a1P12813 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nr4a1P12813 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nr4a1P12813 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nr4a1P12813 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nr4a1P12813 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nr4a1P12813 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nr4a1P12813 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nr4a1P12813 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nr4a1P12813 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nr4a1P12813 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nr4a1P12813 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nr4a1P12813 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nr4a1P12813 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nr4a1P12813 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nr4a1P12813 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nr4a1P12813 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nr4a1P12813 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nr4a1P12813 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nr4a1P12813 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nr4a1P12813 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nr4a1P12813 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nr4a1P12813 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nr4a1P12813 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nr4a1P12813 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nr4a1P12813 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nr4a1P12813 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nr4a1P12813 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nr4a1P12813 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nr4a1P12813 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nr4a1P12813 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nr4a1P12813 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nr4a1P12813 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nr4a1P12813 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nr4a1P12813 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nr4a1P12813 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nr4a1P12813 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nr4a1P12813 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nr4a1P12813 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nr4a1P12813 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nr4a1P12813 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nr4a1P12813 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nr4a1P12813 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nr4a1P12813 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nr4a1P12813 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nr4a1P12813 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nr4a1P12813 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nr4a1P12813 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Nr4a1P12813 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Nr4a1P12813 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Nr4a1P12813 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Nr4a1P12813 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nr4a1P12813 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nr4a1P12813 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Nr4a1P12813 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nr4a1P12813 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nr4a1P12813 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nr4a1P12813 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nr4a1P12813 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nr4a1P12813 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms