Protein–RNA interactions for Protein: P11688

Itga5, Integrin alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga5P11688 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itga5P11688 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itga5P11688 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itga5P11688 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itga5P11688 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itga5P11688 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itga5P11688 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Itga5P11688 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itga5P11688 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itga5P11688 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itga5P11688 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itga5P11688 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itga5P11688 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itga5P11688 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itga5P11688 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itga5P11688 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itga5P11688 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itga5P11688 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Itga5P11688 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itga5P11688 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itga5P11688 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Itga5P11688 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itga5P11688 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Itga5P11688 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Itga5P11688 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itga5P11688 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itga5P11688 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itga5P11688 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itga5P11688 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itga5P11688 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itga5P11688 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itga5P11688 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itga5P11688 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Itga5P11688 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Itga5P11688 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Itga5P11688 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Itga5P11688 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Itga5P11688 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Itga5P11688 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Itga5P11688 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Itga5P11688 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Itga5P11688 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Itga5P11688 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Itga5P11688 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Itga5P11688 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Itga5P11688 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Itga5P11688 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Itga5P11688 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Itga5P11688 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Itga5P11688 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Itga5P11688 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Itga5P11688 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Itga5P11688 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Itga5P11688 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itga5P11688 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itga5P11688 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itga5P11688 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itga5P11688 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itga5P11688 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itga5P11688 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itga5P11688 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itga5P11688 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itga5P11688 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itga5P11688 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itga5P11688 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itga5P11688 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itga5P11688 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itga5P11688 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itga5P11688 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itga5P11688 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itga5P11688 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itga5P11688 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itga5P11688 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itga5P11688 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itga5P11688 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itga5P11688 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itga5P11688 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itga5P11688 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itga5P11688 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itga5P11688 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itga5P11688 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itga5P11688 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itga5P11688 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Itga5P11688 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itga5P11688 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itga5P11688 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Itga5P11688 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itga5P11688 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itga5P11688 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itga5P11688 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itga5P11688 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itga5P11688 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itga5P11688 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itga5P11688 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itga5P11688 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Itga5P11688 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itga5P11688 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itga5P11688 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itga5P11688 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itga5P11688 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms