Protein–RNA interactions for Protein: P11531

Dmd, Dystrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,678 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DmdP11531 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DmdP11531 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DmdP11531 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DmdP11531 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DmdP11531 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DmdP11531 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DmdP11531 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DmdP11531 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DmdP11531 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DmdP11531 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DmdP11531 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DmdP11531 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DmdP11531 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DmdP11531 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DmdP11531 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DmdP11531 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DmdP11531 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DmdP11531 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DmdP11531 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DmdP11531 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DmdP11531 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DmdP11531 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DmdP11531 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DmdP11531 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DmdP11531 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
DmdP11531 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DmdP11531 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DmdP11531 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DmdP11531 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DmdP11531 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DmdP11531 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DmdP11531 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DmdP11531 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
DmdP11531 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
DmdP11531 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DmdP11531 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DmdP11531 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DmdP11531 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DmdP11531 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DmdP11531 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DmdP11531 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DmdP11531 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
DmdP11531 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DmdP11531 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DmdP11531 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DmdP11531 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DmdP11531 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DmdP11531 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DmdP11531 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DmdP11531 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DmdP11531 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DmdP11531 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DmdP11531 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DmdP11531 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DmdP11531 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DmdP11531 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DmdP11531 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DmdP11531 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DmdP11531 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DmdP11531 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
DmdP11531 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
DmdP11531 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DmdP11531 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DmdP11531 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DmdP11531 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DmdP11531 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DmdP11531 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DmdP11531 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DmdP11531 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DmdP11531 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DmdP11531 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DmdP11531 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DmdP11531 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DmdP11531 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DmdP11531 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DmdP11531 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DmdP11531 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
DmdP11531 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
DmdP11531 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
DmdP11531 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DmdP11531 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DmdP11531 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DmdP11531 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DmdP11531 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DmdP11531 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DmdP11531 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DmdP11531 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DmdP11531 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DmdP11531 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
DmdP11531 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
DmdP11531 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DmdP11531 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DmdP11531 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DmdP11531 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DmdP11531 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DmdP11531 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DmdP11531 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DmdP11531 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DmdP11531 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DmdP11531 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms