Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxd4P10628 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxd4P10628 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxd4P10628 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxd4P10628 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxd4P10628 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxd4P10628 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxd4P10628 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxd4P10628 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxd4P10628 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxd4P10628 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxd4P10628 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxd4P10628 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxd4P10628 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxd4P10628 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxd4P10628 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxd4P10628 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxd4P10628 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxd4P10628 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxd4P10628 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxd4P10628 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxd4P10628 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxd4P10628 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxd4P10628 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxd4P10628 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Hoxd4P10628 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Hoxd4P10628 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Hoxd4P10628 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Hoxd4P10628 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Hoxd4P10628 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxd4P10628 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxd4P10628 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxd4P10628 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxd4P10628 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxd4P10628 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxd4P10628 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxd4P10628 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxd4P10628 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxd4P10628 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxd4P10628 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxd4P10628 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxd4P10628 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxd4P10628 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxd4P10628 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxd4P10628 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxd4P10628 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxd4P10628 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxd4P10628 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxd4P10628 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxd4P10628 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxd4P10628 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxd4P10628 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxd4P10628 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxd4P10628 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxd4P10628 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxd4P10628 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxd4P10628 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxd4P10628 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxd4P10628 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxd4P10628 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxd4P10628 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxd4P10628 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxd4P10628 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxd4P10628 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxd4P10628 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxd4P10628 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxd4P10628 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxd4P10628 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxd4P10628 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxd4P10628 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxd4P10628 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxd4P10628 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxd4P10628 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxd4P10628 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxd4P10628 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxd4P10628 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxd4P10628 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxd4P10628 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxd4P10628 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxd4P10628 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxd4P10628 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxd4P10628 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxd4P10628 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxd4P10628 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxd4P10628 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxd4P10628 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxd4P10628 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxd4P10628 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxd4P10628 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxd4P10628 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxd4P10628 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxd4P10628 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxd4P10628 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxd4P10628 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxd4P10628 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxd4P10628 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxd4P10628 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxd4P10628 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxd4P10628 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxd4P10628 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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