Protein–RNA interactions for Protein: P10493

Nid1, Nidogen-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nid1P10493 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Nid1P10493 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nid1P10493 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nid1P10493 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nid1P10493 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nid1P10493 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nid1P10493 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nid1P10493 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nid1P10493 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nid1P10493 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Nid1P10493 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nid1P10493 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nid1P10493 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nid1P10493 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nid1P10493 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nid1P10493 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nid1P10493 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nid1P10493 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nid1P10493 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nid1P10493 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nid1P10493 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nid1P10493 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nid1P10493 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nid1P10493 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nid1P10493 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Nid1P10493 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nid1P10493 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nid1P10493 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nid1P10493 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nid1P10493 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nid1P10493 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Nid1P10493 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nid1P10493 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Nid1P10493 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nid1P10493 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nid1P10493 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nid1P10493 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nid1P10493 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nid1P10493 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nid1P10493 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nid1P10493 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nid1P10493 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nid1P10493 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nid1P10493 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nid1P10493 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nid1P10493 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nid1P10493 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nid1P10493 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nid1P10493 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nid1P10493 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nid1P10493 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nid1P10493 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nid1P10493 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nid1P10493 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nid1P10493 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nid1P10493 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nid1P10493 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Nid1P10493 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Nid1P10493 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nid1P10493 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nid1P10493 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nid1P10493 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nid1P10493 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nid1P10493 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nid1P10493 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nid1P10493 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nid1P10493 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nid1P10493 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nid1P10493 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nid1P10493 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nid1P10493 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Nid1P10493 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nid1P10493 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nid1P10493 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nid1P10493 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nid1P10493 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nid1P10493 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nid1P10493 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nid1P10493 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nid1P10493 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nid1P10493 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nid1P10493 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nid1P10493 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nid1P10493 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nid1P10493 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nid1P10493 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nid1P10493 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nid1P10493 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nid1P10493 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nid1P10493 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nid1P10493 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nid1P10493 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nid1P10493 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nid1P10493 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nid1P10493 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nid1P10493 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nid1P10493 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nid1P10493 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nid1P10493 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nid1P10493 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms