Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
P10404 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
P10404 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
P10404 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
P10404 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
P10404 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
P10404 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
P10404 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
P10404 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
P10404 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
P10404 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
P10404 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
P10404 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
P10404 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
P10404 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
P10404 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
P10404 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
P10404 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
P10404 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
P10404 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
P10404 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
P10404 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
P10404 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
P10404 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
P10404 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
P10404 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
P10404 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
P10404 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
P10404 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
P10404 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
P10404 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
P10404 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
P10404 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
P10404 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
P10404 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
P10404 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
P10404 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
P10404 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
P10404 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
P10404 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
P10404 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
P10404 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
P10404 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
P10404 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
P10404 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
P10404 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
P10404 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
P10404 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
P10404 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
P10404 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
P10404 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
P10404 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
P10404 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
P10404 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
P10404 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
P10404 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
P10404 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.15
P10404 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
P10404 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
P10404 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
P10404 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
P10404 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
P10404 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
P10404 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
P10404 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
P10404 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.16
P10404 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
P10404 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
P10404 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
P10404 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
P10404 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
P10404 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
P10404 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.16
P10404 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
P10404 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
P10404 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
P10404 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
P10404 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
P10404 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
P10404 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
P10404 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
P10404 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
P10404 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
P10404 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
P10404 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
P10404 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
P10404 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
P10404 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
P10404 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
P10404 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
P10404 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
P10404 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
P10404 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
P10404 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
P10404 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
P10404 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
P10404 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
P10404 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
P10404 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
P10404 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
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