Protein–RNA interactions for Protein: P10284

Hoxb4, Homeobox protein Hox-B4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb4P10284 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hoxb4P10284 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxb4P10284 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxb4P10284 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxb4P10284 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxb4P10284 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxb4P10284 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxb4P10284 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxb4P10284 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxb4P10284 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxb4P10284 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxb4P10284 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxb4P10284 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxb4P10284 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxb4P10284 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxb4P10284 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxb4P10284 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxb4P10284 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxb4P10284 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxb4P10284 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxb4P10284 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxb4P10284 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxb4P10284 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxb4P10284 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxb4P10284 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxb4P10284 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxb4P10284 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxb4P10284 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxb4P10284 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxb4P10284 Gm14716-201ENSMUST00000120138 718 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxb4P10284 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxb4P10284 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxb4P10284 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxb4P10284 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxb4P10284 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxb4P10284 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxb4P10284 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxb4P10284 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxb4P10284 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxb4P10284 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxb4P10284 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxb4P10284 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxb4P10284 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxb4P10284 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxb4P10284 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxb4P10284 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxb4P10284 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxb4P10284 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxb4P10284 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxb4P10284 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxb4P10284 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxb4P10284 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxb4P10284 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxb4P10284 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxb4P10284 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxb4P10284 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxb4P10284 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxb4P10284 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxb4P10284 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxb4P10284 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxb4P10284 Gm42626-201ENSMUST00000196866 1148 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxb4P10284 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxb4P10284 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxb4P10284 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxb4P10284 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxb4P10284 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxb4P10284 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxb4P10284 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxb4P10284 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxb4P10284 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxb4P10284 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxb4P10284 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxb4P10284 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxb4P10284 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxb4P10284 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxb4P10284 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxb4P10284 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxb4P10284 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxb4P10284 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxb4P10284 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxb4P10284 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxb4P10284 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxb4P10284 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxb4P10284 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxb4P10284 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxb4P10284 Gemin6-201ENSMUST00000069486 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxb4P10284 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxb4P10284 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxb4P10284 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxb4P10284 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxb4P10284 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxb4P10284 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxb4P10284 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxb4P10284 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxb4P10284 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxb4P10284 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxb4P10284 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxb4P10284 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxb4P10284 Gm26540-201ENSMUST00000181858 1310 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxb4P10284 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms