Protein–RNA interactions for Protein: P0C5K0

Sbk3, Uncharacterized serine/threonine-protein kinase SBK3, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbk3P0C5K0 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sbk3P0C5K0 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sbk3P0C5K0 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sbk3P0C5K0 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sbk3P0C5K0 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sbk3P0C5K0 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Sbk3P0C5K0 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sbk3P0C5K0 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sbk3P0C5K0 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sbk3P0C5K0 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sbk3P0C5K0 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sbk3P0C5K0 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Sbk3P0C5K0 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sbk3P0C5K0 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sbk3P0C5K0 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sbk3P0C5K0 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sbk3P0C5K0 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sbk3P0C5K0 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sbk3P0C5K0 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sbk3P0C5K0 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sbk3P0C5K0 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sbk3P0C5K0 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sbk3P0C5K0 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sbk3P0C5K0 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sbk3P0C5K0 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sbk3P0C5K0 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sbk3P0C5K0 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sbk3P0C5K0 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sbk3P0C5K0 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sbk3P0C5K0 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Sbk3P0C5K0 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sbk3P0C5K0 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Sbk3P0C5K0 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sbk3P0C5K0 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sbk3P0C5K0 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sbk3P0C5K0 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sbk3P0C5K0 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sbk3P0C5K0 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sbk3P0C5K0 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sbk3P0C5K0 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Sbk3P0C5K0 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sbk3P0C5K0 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sbk3P0C5K0 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sbk3P0C5K0 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sbk3P0C5K0 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sbk3P0C5K0 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sbk3P0C5K0 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sbk3P0C5K0 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sbk3P0C5K0 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sbk3P0C5K0 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sbk3P0C5K0 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sbk3P0C5K0 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sbk3P0C5K0 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sbk3P0C5K0 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sbk3P0C5K0 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sbk3P0C5K0 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sbk3P0C5K0 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sbk3P0C5K0 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sbk3P0C5K0 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sbk3P0C5K0 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Sbk3P0C5K0 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sbk3P0C5K0 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Sbk3P0C5K0 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sbk3P0C5K0 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sbk3P0C5K0 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sbk3P0C5K0 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sbk3P0C5K0 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sbk3P0C5K0 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sbk3P0C5K0 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sbk3P0C5K0 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sbk3P0C5K0 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sbk3P0C5K0 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sbk3P0C5K0 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sbk3P0C5K0 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sbk3P0C5K0 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sbk3P0C5K0 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sbk3P0C5K0 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sbk3P0C5K0 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sbk3P0C5K0 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sbk3P0C5K0 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sbk3P0C5K0 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sbk3P0C5K0 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sbk3P0C5K0 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sbk3P0C5K0 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sbk3P0C5K0 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sbk3P0C5K0 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sbk3P0C5K0 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sbk3P0C5K0 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sbk3P0C5K0 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sbk3P0C5K0 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sbk3P0C5K0 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sbk3P0C5K0 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sbk3P0C5K0 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sbk3P0C5K0 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sbk3P0C5K0 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sbk3P0C5K0 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sbk3P0C5K0 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sbk3P0C5K0 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sbk3P0C5K0 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sbk3P0C5K0 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms