Protein–RNA interactions for Protein: P0C5E4

Ptprq, Phosphatidylinositol phosphatase PTPRQ, mousemouse

Predictions only

Length 2,300 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprqP0C5E4 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
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PtprqP0C5E4 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
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PtprqP0C5E4 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprqP0C5E4 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprqP0C5E4 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
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PtprqP0C5E4 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprqP0C5E4 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprqP0C5E4 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprqP0C5E4 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
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PtprqP0C5E4 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
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PtprqP0C5E4 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
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PtprqP0C5E4 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtprqP0C5E4 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
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PtprqP0C5E4 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PtprqP0C5E4 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PtprqP0C5E4 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PtprqP0C5E4 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PtprqP0C5E4 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PtprqP0C5E4 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PtprqP0C5E4 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
PtprqP0C5E4 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PtprqP0C5E4 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PtprqP0C5E4 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PtprqP0C5E4 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
PtprqP0C5E4 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PtprqP0C5E4 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PtprqP0C5E4 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PtprqP0C5E4 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PtprqP0C5E4 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PtprqP0C5E4 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PtprqP0C5E4 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PtprqP0C5E4 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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