Protein–RNA interactions for Protein: P09055

Itgb1, Integrin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb1P09055 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itgb1P09055 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itgb1P09055 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itgb1P09055 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itgb1P09055 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itgb1P09055 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itgb1P09055 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itgb1P09055 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itgb1P09055 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itgb1P09055 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itgb1P09055 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Itgb1P09055 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itgb1P09055 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itgb1P09055 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itgb1P09055 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itgb1P09055 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itgb1P09055 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itgb1P09055 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itgb1P09055 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itgb1P09055 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itgb1P09055 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itgb1P09055 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itgb1P09055 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Itgb1P09055 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Itgb1P09055 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Itgb1P09055 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Itgb1P09055 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Itgb1P09055 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Itgb1P09055 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Itgb1P09055 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Itgb1P09055 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Itgb1P09055 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Itgb1P09055 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Itgb1P09055 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Itgb1P09055 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Itgb1P09055 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Itgb1P09055 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Itgb1P09055 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Itgb1P09055 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Itgb1P09055 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Itgb1P09055 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Itgb1P09055 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Itgb1P09055 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Itgb1P09055 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itgb1P09055 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itgb1P09055 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itgb1P09055 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itgb1P09055 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Itgb1P09055 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itgb1P09055 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itgb1P09055 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itgb1P09055 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itgb1P09055 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itgb1P09055 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itgb1P09055 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itgb1P09055 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itgb1P09055 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itgb1P09055 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itgb1P09055 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itgb1P09055 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itgb1P09055 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itgb1P09055 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itgb1P09055 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itgb1P09055 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itgb1P09055 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itgb1P09055 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itgb1P09055 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Itgb1P09055 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itgb1P09055 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itgb1P09055 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itgb1P09055 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itgb1P09055 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itgb1P09055 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itgb1P09055 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itgb1P09055 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itgb1P09055 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itgb1P09055 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itgb1P09055 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Itgb1P09055 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Itgb1P09055 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Itgb1P09055 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Itgb1P09055 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Itgb1P09055 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Itgb1P09055 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Itgb1P09055 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Itgb1P09055 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Itgb1P09055 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Itgb1P09055 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Itgb1P09055 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Itgb1P09055 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Itgb1P09055 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Itgb1P09055 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Itgb1P09055 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Itgb1P09055 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Itgb1P09055 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Itgb1P09055 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Itgb1P09055 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Itgb1P09055 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Itgb1P09055 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Itgb1P09055 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms