Protein–RNA interactions for Protein: P09021

Hoxa5, Homeobox protein Hox-A5, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa5P09021 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxa5P09021 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxa5P09021 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxa5P09021 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxa5P09021 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxa5P09021 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxa5P09021 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxa5P09021 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hoxa5P09021 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxa5P09021 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxa5P09021 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxa5P09021 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxa5P09021 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxa5P09021 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxa5P09021 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxa5P09021 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxa5P09021 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxa5P09021 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxa5P09021 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxa5P09021 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxa5P09021 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxa5P09021 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxa5P09021 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxa5P09021 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxa5P09021 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxa5P09021 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxa5P09021 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxa5P09021 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxa5P09021 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxa5P09021 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxa5P09021 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxa5P09021 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxa5P09021 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxa5P09021 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxa5P09021 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxa5P09021 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxa5P09021 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxa5P09021 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxa5P09021 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxa5P09021 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxa5P09021 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxa5P09021 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxa5P09021 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxa5P09021 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxa5P09021 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxa5P09021 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxa5P09021 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxa5P09021 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxa5P09021 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxa5P09021 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxa5P09021 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxa5P09021 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxa5P09021 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxa5P09021 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxa5P09021 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxa5P09021 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxa5P09021 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxa5P09021 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxa5P09021 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxa5P09021 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxa5P09021 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxa5P09021 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxa5P09021 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxa5P09021 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxa5P09021 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxa5P09021 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxa5P09021 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxa5P09021 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxa5P09021 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxa5P09021 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxa5P09021 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxa5P09021 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxa5P09021 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxa5P09021 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxa5P09021 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxa5P09021 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxa5P09021 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxa5P09021 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxa5P09021 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxa5P09021 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxa5P09021 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxa5P09021 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxa5P09021 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxa5P09021 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxa5P09021 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxa5P09021 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxa5P09021 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxa5P09021 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxa5P09021 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxa5P09021 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxa5P09021 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxa5P09021 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxa5P09021 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxa5P09021 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxa5P09021 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxa5P09021 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxa5P09021 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxa5P09021 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxa5P09021 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxa5P09021 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms