Protein–RNA interactions for Protein: P08046

Egr1, Early growth response protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Egr1P08046 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Egr1P08046 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Egr1P08046 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Egr1P08046 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Egr1P08046 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Egr1P08046 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Egr1P08046 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Egr1P08046 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Egr1P08046 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Egr1P08046 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Egr1P08046 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Egr1P08046 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Egr1P08046 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Egr1P08046 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Egr1P08046 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Egr1P08046 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Egr1P08046 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Egr1P08046 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Egr1P08046 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Egr1P08046 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Egr1P08046 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Egr1P08046 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Egr1P08046 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Egr1P08046 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Egr1P08046 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Egr1P08046 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Egr1P08046 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Egr1P08046 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Egr1P08046 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Egr1P08046 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Egr1P08046 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Egr1P08046 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Egr1P08046 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Egr1P08046 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Egr1P08046 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Egr1P08046 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Egr1P08046 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Egr1P08046 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Egr1P08046 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Egr1P08046 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Egr1P08046 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Egr1P08046 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Egr1P08046 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Egr1P08046 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Egr1P08046 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Egr1P08046 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Egr1P08046 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Egr1P08046 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Egr1P08046 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Egr1P08046 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Egr1P08046 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Egr1P08046 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Egr1P08046 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Egr1P08046 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Egr1P08046 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Egr1P08046 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Egr1P08046 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Egr1P08046 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Egr1P08046 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Egr1P08046 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Egr1P08046 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Egr1P08046 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Egr1P08046 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Egr1P08046 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Egr1P08046 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Egr1P08046 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Egr1P08046 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Egr1P08046 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Egr1P08046 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Egr1P08046 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Egr1P08046 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Egr1P08046 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Egr1P08046 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Egr1P08046 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Egr1P08046 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Egr1P08046 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Egr1P08046 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Egr1P08046 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Egr1P08046 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Egr1P08046 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Egr1P08046 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Egr1P08046 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Egr1P08046 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Egr1P08046 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Egr1P08046 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Egr1P08046 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Egr1P08046 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Egr1P08046 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Egr1P08046 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Egr1P08046 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Egr1P08046 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Egr1P08046 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Egr1P08046 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Egr1P08046 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Egr1P08046 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Egr1P08046 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Egr1P08046 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Egr1P08046 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Egr1P08046 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Egr1P08046 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms