Protein–RNA interactions for Protein: P06683

C9, Complement component C9, mousemouse

Predictions only

Length 548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9P06683 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9P06683 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9P06683 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9P06683 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9P06683 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9P06683 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9P06683 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9P06683 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9P06683 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9P06683 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9P06683 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9P06683 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9P06683 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9P06683 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9P06683 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9P06683 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9P06683 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9P06683 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9P06683 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9P06683 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9P06683 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9P06683 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9P06683 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9P06683 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9P06683 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9P06683 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9P06683 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9P06683 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
C9P06683 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9P06683 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9P06683 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9P06683 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9P06683 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9P06683 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9P06683 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9P06683 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9P06683 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9P06683 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9P06683 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9P06683 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9P06683 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9P06683 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9P06683 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9P06683 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9P06683 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9P06683 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9P06683 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9P06683 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
C9P06683 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9P06683 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9P06683 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9P06683 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9P06683 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9P06683 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9P06683 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9P06683 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9P06683 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9P06683 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9P06683 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9P06683 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9P06683 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9P06683 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9P06683 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9P06683 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9P06683 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
C9P06683 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9P06683 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9P06683 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9P06683 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9P06683 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9P06683 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9P06683 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9P06683 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9P06683 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9P06683 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9P06683 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9P06683 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9P06683 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9P06683 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9P06683 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9P06683 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9P06683 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9P06683 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9P06683 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9P06683 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9P06683 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9P06683 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9P06683 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9P06683 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9P06683 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9P06683 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9P06683 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9P06683 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9P06683 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9P06683 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9P06683 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9P06683 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9P06683 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9P06683 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
C9P06683 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms