Protein–RNA interactions for Protein: P04213

T-cell receptor beta chain V region C5 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04213 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P04213 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P04213 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P04213 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P04213 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P04213 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P04213 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P04213 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P04213 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P04213 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P04213 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P04213 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P04213 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P04213 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P04213 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P04213 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P04213 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P04213 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P04213 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P04213 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P04213 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P04213 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P04213 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P04213 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P04213 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P04213 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P04213 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
P04213 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P04213 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P04213 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P04213 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P04213 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P04213 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P04213 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P04213 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
P04213 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
P04213 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P04213 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P04213 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P04213 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P04213 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P04213 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P04213 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P04213 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P04213 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P04213 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
P04213 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
P04213 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P04213 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P04213 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P04213 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P04213 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P04213 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P04213 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P04213 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P04213 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P04213 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P04213 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P04213 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
P04213 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P04213 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P04213 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P04213 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P04213 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P04213 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P04213 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
P04213 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
P04213 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P04213 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P04213 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P04213 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P04213 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P04213 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P04213 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
P04213 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P04213 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P04213 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P04213 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P04213 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P04213 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P04213 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P04213 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P04213 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P04213 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P04213 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P04213 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P04213 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P04213 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P04213 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P04213 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P04213 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P04213 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P04213 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P04213 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
P04213 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P04213 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P04213 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P04213 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P04213 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P04213 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms