Protein–RNA interactions for Protein: P04212

T-cell receptor beta chain V region LB2, mousemouse

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Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04212 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P04212 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P04212 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P04212 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P04212 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P04212 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P04212 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P04212 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P04212 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
P04212 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P04212 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P04212 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P04212 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P04212 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
P04212 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
P04212 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
P04212 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
P04212 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
P04212 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
P04212 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P04212 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P04212 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P04212 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
P04212 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P04212 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P04212 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
P04212 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P04212 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P04212 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
P04212 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P04212 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P04212 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P04212 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P04212 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P04212 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
P04212 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
P04212 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P04212 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P04212 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P04212 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P04212 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
P04212 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P04212 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
P04212 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P04212 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P04212 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P04212 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P04212 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
P04212 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P04212 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P04212 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P04212 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
P04212 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
P04212 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P04212 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P04212 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P04212 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P04212 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P04212 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P04212 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P04212 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P04212 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
P04212 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P04212 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P04212 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P04212 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P04212 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
P04212 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P04212 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P04212 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
P04212 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
P04212 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
P04212 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
P04212 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
P04212 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
P04212 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
P04212 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P04212 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
P04212 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
P04212 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
P04212 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P04212 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P04212 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
P04212 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P04212 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P04212 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P04212 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P04212 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P04212 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P04212 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
P04212 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P04212 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P04212 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P04212 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P04212 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P04212 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P04212 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P04212 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
P04212 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
P04212 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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