Protein–RNA interactions for Protein: P01740

T-cell receptor gamma chain V region V108A, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01740 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01740 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01740 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01740 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01740 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01740 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01740 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01740 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01740 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01740 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01740 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01740 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01740 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01740 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01740 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01740 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01740 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01740 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01740 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01740 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01740 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01740 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01740 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01740 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01740 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01740 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01740 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01740 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01740 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01740 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01740 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
P01740 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01740 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01740 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01740 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01740 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01740 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01740 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01740 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01740 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01740 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
P01740 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01740 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01740 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
P01740 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01740 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01740 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01740 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01740 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01740 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01740 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01740 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01740 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01740 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
P01740 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01740 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01740 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01740 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
P01740 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01740 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01740 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01740 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01740 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01740 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01740 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01740 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
P01740 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01740 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01740 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01740 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01740 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01740 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
P01740 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01740 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01740 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01740 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01740 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01740 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01740 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
P01740 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01740 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01740 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01740 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01740 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01740 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01740 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01740 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01740 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01740 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01740 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01740 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01740 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01740 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01740 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
P01740 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
P01740 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
P01740 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
P01740 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
P01740 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
P01740 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms