Protein–RNA interactions for Protein: P01672

Ig kappa chain V-III region PC 7940, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01672 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01672 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01672 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
P01672 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01672 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01672 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01672 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01672 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01672 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
P01672 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01672 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01672 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
P01672 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01672 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01672 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01672 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01672 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01672 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01672 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01672 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01672 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01672 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01672 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01672 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01672 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01672 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01672 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01672 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01672 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01672 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01672 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01672 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01672 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01672 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01672 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01672 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01672 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01672 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01672 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01672 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01672 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01672 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01672 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01672 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
P01672 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
P01672 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01672 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01672 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01672 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01672 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01672 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01672 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01672 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01672 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01672 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01672 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01672 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
P01672 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01672 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01672 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01672 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01672 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01672 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01672 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
P01672 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01672 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01672 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
P01672 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01672 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01672 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01672 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01672 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01672 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01672 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01672 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01672 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01672 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01672 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01672 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01672 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01672 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01672 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01672 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01672 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01672 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01672 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01672 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01672 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01672 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01672 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01672 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01672 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01672 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01672 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01672 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01672 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01672 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01672 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01672 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01672 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms