Protein–RNA interactions for Protein: P01667

Ig kappa chain V-III region PC 6308, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01667 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
P01667 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
P01667 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
P01667 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01667 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01667 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01667 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01667 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01667 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
P01667 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01667 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
P01667 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01667 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01667 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01667 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01667 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01667 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01667 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01667 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01667 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01667 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
P01667 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01667 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01667 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01667 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01667 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01667 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01667 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01667 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01667 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01667 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
P01667 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01667 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01667 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01667 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01667 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01667 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01667 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01667 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01667 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01667 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01667 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01667 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
P01667 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01667 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01667 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01667 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01667 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01667 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01667 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01667 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01667 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01667 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01667 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01667 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
P01667 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01667 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01667 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01667 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
P01667 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01667 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01667 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
P01667 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01667 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01667 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01667 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01667 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01667 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01667 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01667 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01667 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01667 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01667 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01667 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01667 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01667 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01667 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01667 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01667 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01667 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01667 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01667 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01667 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01667 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01667 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01667 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01667 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01667 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
P01667 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01667 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01667 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01667 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01667 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01667 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01667 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01667 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01667 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01667 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01667 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01667 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms