Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccl20O89093 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccl20O89093 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccl20O89093 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccl20O89093 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccl20O89093 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccl20O89093 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccl20O89093 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccl20O89093 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccl20O89093 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccl20O89093 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccl20O89093 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccl20O89093 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccl20O89093 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccl20O89093 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccl20O89093 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccl20O89093 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccl20O89093 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccl20O89093 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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Ccl20O89093 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccl20O89093 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccl20O89093 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccl20O89093 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccl20O89093 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
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Ccl20O89093 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ccl20O89093 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ccl20O89093 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ccl20O89093 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
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Ccl20O89093 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ccl20O89093 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ccl20O89093 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ccl20O89093 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ccl20O89093 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ccl20O89093 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ccl20O89093 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ccl20O89093 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ccl20O89093 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ccl20O89093 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ccl20O89093 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ccl20O89093 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ccl20O89093 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ccl20O89093 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ccl20O89093 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ccl20O89093 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ccl20O89093 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ccl20O89093 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ccl20O89093 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ccl20O89093 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
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Ccl20O89093 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ccl20O89093 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ccl20O89093 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ccl20O89093 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ccl20O89093 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ccl20O89093 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ccl20O89093 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ccl20O89093 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ccl20O89093 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
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Ccl20O89093 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
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Ccl20O89093 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ccl20O89093 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ccl20O89093 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ccl20O89093 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ccl20O89093 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Ccl20O89093 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Ccl20O89093 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Ccl20O89093 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Ccl20O89093 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Ccl20O89093 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Ccl20O89093 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Ccl20O89093 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Ccl20O89093 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Ccl20O89093 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Ccl20O89093 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Ccl20O89093 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Ccl20O89093 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Ccl20O89093 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Ccl20O89093 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Ccl20O89093 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Ccl20O89093 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Ccl20O89093 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Ccl20O89093 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Ccl20O89093 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Ccl20O89093 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Ccl20O89093 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Ccl20O89093 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Ccl20O89093 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Ccl20O89093 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Ccl20O89093 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
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