Protein–RNA interactions for Protein: O89079

Cope, Coatomer subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CopeO89079 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CopeO89079 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CopeO89079 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CopeO89079 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CopeO89079 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CopeO89079 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CopeO89079 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CopeO89079 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CopeO89079 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CopeO89079 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CopeO89079 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CopeO89079 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CopeO89079 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CopeO89079 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CopeO89079 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CopeO89079 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CopeO89079 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CopeO89079 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CopeO89079 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CopeO89079 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CopeO89079 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CopeO89079 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CopeO89079 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CopeO89079 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CopeO89079 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CopeO89079 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CopeO89079 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CopeO89079 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CopeO89079 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CopeO89079 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CopeO89079 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CopeO89079 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CopeO89079 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CopeO89079 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CopeO89079 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CopeO89079 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CopeO89079 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CopeO89079 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CopeO89079 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CopeO89079 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CopeO89079 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CopeO89079 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CopeO89079 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CopeO89079 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CopeO89079 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CopeO89079 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CopeO89079 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CopeO89079 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CopeO89079 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CopeO89079 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CopeO89079 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CopeO89079 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CopeO89079 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CopeO89079 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CopeO89079 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CopeO89079 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CopeO89079 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CopeO89079 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CopeO89079 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CopeO89079 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CopeO89079 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CopeO89079 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CopeO89079 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CopeO89079 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CopeO89079 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CopeO89079 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CopeO89079 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CopeO89079 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CopeO89079 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CopeO89079 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CopeO89079 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CopeO89079 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CopeO89079 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CopeO89079 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CopeO89079 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CopeO89079 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CopeO89079 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CopeO89079 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CopeO89079 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CopeO89079 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CopeO89079 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CopeO89079 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CopeO89079 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CopeO89079 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CopeO89079 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CopeO89079 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CopeO89079 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CopeO89079 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CopeO89079 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CopeO89079 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CopeO89079 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CopeO89079 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CopeO89079 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CopeO89079 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CopeO89079 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CopeO89079 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CopeO89079 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CopeO89079 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CopeO89079 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CopeO89079 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms