Protein–RNA interactions for Protein: O88875

Cd160, CD160 antigen, mousemouse

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Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd160O88875 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cd160O88875 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cd160O88875 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Cd160O88875 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cd160O88875 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Cd160O88875 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cd160O88875 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cd160O88875 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Cd160O88875 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cd160O88875 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cd160O88875 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cd160O88875 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cd160O88875 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cd160O88875 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cd160O88875 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cd160O88875 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cd160O88875 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cd160O88875 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cd160O88875 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cd160O88875 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cd160O88875 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cd160O88875 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cd160O88875 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cd160O88875 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cd160O88875 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cd160O88875 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cd160O88875 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cd160O88875 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cd160O88875 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cd160O88875 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cd160O88875 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cd160O88875 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cd160O88875 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cd160O88875 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cd160O88875 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cd160O88875 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cd160O88875 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cd160O88875 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cd160O88875 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cd160O88875 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cd160O88875 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cd160O88875 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cd160O88875 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cd160O88875 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cd160O88875 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cd160O88875 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cd160O88875 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cd160O88875 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cd160O88875 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cd160O88875 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cd160O88875 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cd160O88875 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cd160O88875 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cd160O88875 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cd160O88875 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cd160O88875 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Cd160O88875 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cd160O88875 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cd160O88875 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cd160O88875 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cd160O88875 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cd160O88875 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cd160O88875 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cd160O88875 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cd160O88875 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cd160O88875 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Cd160O88875 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cd160O88875 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cd160O88875 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cd160O88875 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cd160O88875 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cd160O88875 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cd160O88875 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cd160O88875 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cd160O88875 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cd160O88875 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cd160O88875 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cd160O88875 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cd160O88875 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cd160O88875 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cd160O88875 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cd160O88875 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cd160O88875 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cd160O88875 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Cd160O88875 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cd160O88875 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cd160O88875 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cd160O88875 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cd160O88875 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cd160O88875 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cd160O88875 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cd160O88875 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cd160O88875 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Cd160O88875 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Cd160O88875 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Cd160O88875 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Cd160O88875 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Cd160O88875 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cd160O88875 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cd160O88875 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms