Protein–RNA interactions for Protein: O88874

Ccnk, Cyclin-K, mousemouse

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Length 554 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnkO88874 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CcnkO88874 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CcnkO88874 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CcnkO88874 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CcnkO88874 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CcnkO88874 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CcnkO88874 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CcnkO88874 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CcnkO88874 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CcnkO88874 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CcnkO88874 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CcnkO88874 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CcnkO88874 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CcnkO88874 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CcnkO88874 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CcnkO88874 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CcnkO88874 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CcnkO88874 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CcnkO88874 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CcnkO88874 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CcnkO88874 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CcnkO88874 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CcnkO88874 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CcnkO88874 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CcnkO88874 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CcnkO88874 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CcnkO88874 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CcnkO88874 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CcnkO88874 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CcnkO88874 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CcnkO88874 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CcnkO88874 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CcnkO88874 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CcnkO88874 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CcnkO88874 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CcnkO88874 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CcnkO88874 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CcnkO88874 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CcnkO88874 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CcnkO88874 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CcnkO88874 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CcnkO88874 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CcnkO88874 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CcnkO88874 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CcnkO88874 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CcnkO88874 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CcnkO88874 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CcnkO88874 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CcnkO88874 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CcnkO88874 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CcnkO88874 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CcnkO88874 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CcnkO88874 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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CcnkO88874 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CcnkO88874 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CcnkO88874 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CcnkO88874 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CcnkO88874 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CcnkO88874 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CcnkO88874 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CcnkO88874 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CcnkO88874 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CcnkO88874 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CcnkO88874 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CcnkO88874 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CcnkO88874 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CcnkO88874 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CcnkO88874 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CcnkO88874 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CcnkO88874 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CcnkO88874 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CcnkO88874 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CcnkO88874 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CcnkO88874 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CcnkO88874 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CcnkO88874 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CcnkO88874 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CcnkO88874 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CcnkO88874 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CcnkO88874 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CcnkO88874 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CcnkO88874 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CcnkO88874 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CcnkO88874 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CcnkO88874 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CcnkO88874 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CcnkO88874 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CcnkO88874 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CcnkO88874 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CcnkO88874 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CcnkO88874 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CcnkO88874 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CcnkO88874 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CcnkO88874 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CcnkO88874 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CcnkO88874 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CcnkO88874 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CcnkO88874 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CcnkO88874 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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