Protein–RNA interactions for Protein: O88700

Blm, Bloom syndrome protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BlmO88700 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
BlmO88700 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
BlmO88700 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
BlmO88700 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BlmO88700 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
BlmO88700 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BlmO88700 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
BlmO88700 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BlmO88700 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
BlmO88700 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BlmO88700 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BlmO88700 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BlmO88700 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BlmO88700 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BlmO88700 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
BlmO88700 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
BlmO88700 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
BlmO88700 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
BlmO88700 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BlmO88700 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BlmO88700 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BlmO88700 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
BlmO88700 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
BlmO88700 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BlmO88700 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
BlmO88700 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BlmO88700 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BlmO88700 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BlmO88700 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BlmO88700 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
BlmO88700 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BlmO88700 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
BlmO88700 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
BlmO88700 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
BlmO88700 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
BlmO88700 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
BlmO88700 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
BlmO88700 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BlmO88700 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BlmO88700 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BlmO88700 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BlmO88700 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BlmO88700 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
BlmO88700 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
BlmO88700 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
BlmO88700 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
BlmO88700 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BlmO88700 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
BlmO88700 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BlmO88700 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BlmO88700 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BlmO88700 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
BlmO88700 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
BlmO88700 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BlmO88700 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BlmO88700 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BlmO88700 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BlmO88700 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BlmO88700 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BlmO88700 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
BlmO88700 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BlmO88700 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
BlmO88700 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BlmO88700 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
BlmO88700 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BlmO88700 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
BlmO88700 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BlmO88700 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BlmO88700 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BlmO88700 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BlmO88700 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BlmO88700 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BlmO88700 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BlmO88700 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BlmO88700 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
BlmO88700 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
BlmO88700 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
BlmO88700 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BlmO88700 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
BlmO88700 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BlmO88700 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BlmO88700 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BlmO88700 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BlmO88700 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BlmO88700 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BlmO88700 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BlmO88700 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
BlmO88700 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BlmO88700 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BlmO88700 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BlmO88700 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BlmO88700 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BlmO88700 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
BlmO88700 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BlmO88700 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
BlmO88700 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BlmO88700 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
BlmO88700 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
BlmO88700 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BlmO88700 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms