Protein–RNA interactions for Protein: O88384

Vti1b, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1B, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vti1bO88384 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vti1bO88384 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vti1bO88384 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vti1bO88384 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vti1bO88384 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vti1bO88384 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vti1bO88384 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vti1bO88384 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vti1bO88384 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vti1bO88384 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vti1bO88384 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vti1bO88384 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vti1bO88384 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vti1bO88384 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vti1bO88384 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vti1bO88384 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vti1bO88384 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vti1bO88384 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vti1bO88384 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Vti1bO88384 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vti1bO88384 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vti1bO88384 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vti1bO88384 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vti1bO88384 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vti1bO88384 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vti1bO88384 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vti1bO88384 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vti1bO88384 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vti1bO88384 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vti1bO88384 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vti1bO88384 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vti1bO88384 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vti1bO88384 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vti1bO88384 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vti1bO88384 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vti1bO88384 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vti1bO88384 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vti1bO88384 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vti1bO88384 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vti1bO88384 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vti1bO88384 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vti1bO88384 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vti1bO88384 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vti1bO88384 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vti1bO88384 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vti1bO88384 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vti1bO88384 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vti1bO88384 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Vti1bO88384 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vti1bO88384 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Vti1bO88384 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vti1bO88384 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vti1bO88384 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vti1bO88384 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vti1bO88384 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vti1bO88384 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vti1bO88384 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vti1bO88384 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vti1bO88384 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vti1bO88384 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vti1bO88384 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vti1bO88384 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vti1bO88384 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vti1bO88384 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vti1bO88384 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vti1bO88384 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vti1bO88384 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vti1bO88384 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vti1bO88384 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vti1bO88384 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vti1bO88384 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Vti1bO88384 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vti1bO88384 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vti1bO88384 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vti1bO88384 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vti1bO88384 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vti1bO88384 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vti1bO88384 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Vti1bO88384 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vti1bO88384 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vti1bO88384 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vti1bO88384 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vti1bO88384 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vti1bO88384 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vti1bO88384 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vti1bO88384 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vti1bO88384 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vti1bO88384 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vti1bO88384 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vti1bO88384 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Vti1bO88384 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vti1bO88384 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vti1bO88384 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vti1bO88384 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vti1bO88384 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vti1bO88384 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vti1bO88384 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vti1bO88384 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vti1bO88384 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vti1bO88384 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms