Protein–RNA interactions for Protein: O88346

Tnnt1, Troponin T, slow skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt1O88346 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tnnt1O88346 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tnnt1O88346 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tnnt1O88346 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tnnt1O88346 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tnnt1O88346 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tnnt1O88346 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tnnt1O88346 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tnnt1O88346 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tnnt1O88346 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tnnt1O88346 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tnnt1O88346 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tnnt1O88346 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Tnnt1O88346 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tnnt1O88346 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tnnt1O88346 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tnnt1O88346 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tnnt1O88346 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tnnt1O88346 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tnnt1O88346 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tnnt1O88346 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tnnt1O88346 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tnnt1O88346 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tnnt1O88346 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Tnnt1O88346 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tnnt1O88346 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tnnt1O88346 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tnnt1O88346 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tnnt1O88346 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tnnt1O88346 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Tnnt1O88346 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tnnt1O88346 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tnnt1O88346 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tnnt1O88346 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tnnt1O88346 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tnnt1O88346 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tnnt1O88346 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tnnt1O88346 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tnnt1O88346 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tnnt1O88346 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tnnt1O88346 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tnnt1O88346 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tnnt1O88346 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tnnt1O88346 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tnnt1O88346 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tnnt1O88346 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tnnt1O88346 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tnnt1O88346 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tnnt1O88346 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tnnt1O88346 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tnnt1O88346 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tnnt1O88346 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tnnt1O88346 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tnnt1O88346 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tnnt1O88346 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tnnt1O88346 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tnnt1O88346 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tnnt1O88346 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tnnt1O88346 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tnnt1O88346 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tnnt1O88346 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tnnt1O88346 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tnnt1O88346 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tnnt1O88346 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tnnt1O88346 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tnnt1O88346 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tnnt1O88346 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tnnt1O88346 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tnnt1O88346 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tnnt1O88346 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tnnt1O88346 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tnnt1O88346 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tnnt1O88346 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tnnt1O88346 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tnnt1O88346 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tnnt1O88346 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tnnt1O88346 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tnnt1O88346 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tnnt1O88346 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tnnt1O88346 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tnnt1O88346 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tnnt1O88346 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tnnt1O88346 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tnnt1O88346 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tnnt1O88346 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tnnt1O88346 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tnnt1O88346 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tnnt1O88346 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tnnt1O88346 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tnnt1O88346 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tnnt1O88346 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tnnt1O88346 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tnnt1O88346 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tnnt1O88346 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tnnt1O88346 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tnnt1O88346 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tnnt1O88346 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tnnt1O88346 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tnnt1O88346 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tnnt1O88346 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.6 ms