Protein–RNA interactions for Protein: O70589

Cask, Peripheral plasma membrane protein CASK, mousemouse

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CaskO70589 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CaskO70589 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CaskO70589 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CaskO70589 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CaskO70589 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CaskO70589 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CaskO70589 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CaskO70589 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CaskO70589 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CaskO70589 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CaskO70589 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CaskO70589 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CaskO70589 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CaskO70589 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CaskO70589 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CaskO70589 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CaskO70589 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CaskO70589 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CaskO70589 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CaskO70589 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CaskO70589 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CaskO70589 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CaskO70589 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CaskO70589 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CaskO70589 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CaskO70589 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CaskO70589 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CaskO70589 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CaskO70589 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CaskO70589 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CaskO70589 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CaskO70589 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CaskO70589 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CaskO70589 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CaskO70589 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CaskO70589 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CaskO70589 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CaskO70589 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CaskO70589 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CaskO70589 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CaskO70589 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CaskO70589 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CaskO70589 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CaskO70589 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CaskO70589 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CaskO70589 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CaskO70589 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CaskO70589 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CaskO70589 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CaskO70589 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CaskO70589 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CaskO70589 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CaskO70589 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CaskO70589 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CaskO70589 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CaskO70589 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CaskO70589 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CaskO70589 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CaskO70589 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CaskO70589 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CaskO70589 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CaskO70589 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CaskO70589 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CaskO70589 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CaskO70589 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CaskO70589 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CaskO70589 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CaskO70589 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CaskO70589 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CaskO70589 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CaskO70589 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CaskO70589 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CaskO70589 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CaskO70589 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CaskO70589 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CaskO70589 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CaskO70589 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CaskO70589 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CaskO70589 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CaskO70589 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CaskO70589 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CaskO70589 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CaskO70589 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CaskO70589 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CaskO70589 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CaskO70589 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CaskO70589 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CaskO70589 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CaskO70589 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CaskO70589 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CaskO70589 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CaskO70589 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CaskO70589 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CaskO70589 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CaskO70589 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CaskO70589 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CaskO70589 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CaskO70589 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CaskO70589 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CaskO70589 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms