Protein–RNA interactions for Protein: O70480

Vamp4, Vesicle-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp4O70480 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Vamp4O70480 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Vamp4O70480 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Vamp4O70480 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Vamp4O70480 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Vamp4O70480 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Vamp4O70480 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Vamp4O70480 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Vamp4O70480 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Vamp4O70480 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Vamp4O70480 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Vamp4O70480 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Vamp4O70480 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Vamp4O70480 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Vamp4O70480 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Vamp4O70480 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Vamp4O70480 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Vamp4O70480 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Vamp4O70480 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Vamp4O70480 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Vamp4O70480 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Vamp4O70480 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Vamp4O70480 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Vamp4O70480 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Vamp4O70480 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Vamp4O70480 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Vamp4O70480 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Vamp4O70480 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Vamp4O70480 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Vamp4O70480 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Vamp4O70480 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Vamp4O70480 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Vamp4O70480 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Vamp4O70480 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Vamp4O70480 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Vamp4O70480 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Vamp4O70480 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Vamp4O70480 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Vamp4O70480 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Vamp4O70480 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Vamp4O70480 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Vamp4O70480 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Vamp4O70480 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Vamp4O70480 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Vamp4O70480 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Vamp4O70480 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Vamp4O70480 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Vamp4O70480 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Vamp4O70480 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Vamp4O70480 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Vamp4O70480 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Vamp4O70480 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Vamp4O70480 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Vamp4O70480 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Vamp4O70480 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Vamp4O70480 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Vamp4O70480 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Vamp4O70480 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Vamp4O70480 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Vamp4O70480 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Vamp4O70480 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Vamp4O70480 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Vamp4O70480 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Vamp4O70480 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Vamp4O70480 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Vamp4O70480 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Vamp4O70480 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Vamp4O70480 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Vamp4O70480 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Vamp4O70480 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Vamp4O70480 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Vamp4O70480 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Vamp4O70480 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Vamp4O70480 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Vamp4O70480 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Vamp4O70480 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Vamp4O70480 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Vamp4O70480 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Vamp4O70480 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Vamp4O70480 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Vamp4O70480 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Vamp4O70480 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Vamp4O70480 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Vamp4O70480 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Vamp4O70480 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Vamp4O70480 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Vamp4O70480 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Vamp4O70480 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Vamp4O70480 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Vamp4O70480 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Vamp4O70480 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Vamp4O70480 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Vamp4O70480 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Vamp4O70480 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Vamp4O70480 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Vamp4O70480 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Vamp4O70480 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Vamp4O70480 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Vamp4O70480 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Vamp4O70480 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.4 ms