Protein–RNA interactions for Protein: O55144

Tlx3, T-cell leukemia homeobox protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlx3O55144 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tlx3O55144 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tlx3O55144 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tlx3O55144 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tlx3O55144 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tlx3O55144 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tlx3O55144 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tlx3O55144 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tlx3O55144 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tlx3O55144 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tlx3O55144 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tlx3O55144 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tlx3O55144 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tlx3O55144 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tlx3O55144 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tlx3O55144 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tlx3O55144 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tlx3O55144 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tlx3O55144 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tlx3O55144 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tlx3O55144 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tlx3O55144 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tlx3O55144 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tlx3O55144 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tlx3O55144 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tlx3O55144 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tlx3O55144 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tlx3O55144 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tlx3O55144 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tlx3O55144 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tlx3O55144 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tlx3O55144 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tlx3O55144 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tlx3O55144 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tlx3O55144 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tlx3O55144 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tlx3O55144 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tlx3O55144 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tlx3O55144 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tlx3O55144 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tlx3O55144 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tlx3O55144 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tlx3O55144 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tlx3O55144 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tlx3O55144 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tlx3O55144 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tlx3O55144 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tlx3O55144 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tlx3O55144 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tlx3O55144 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tlx3O55144 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tlx3O55144 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tlx3O55144 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tlx3O55144 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tlx3O55144 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tlx3O55144 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Tlx3O55144 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tlx3O55144 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tlx3O55144 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tlx3O55144 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tlx3O55144 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tlx3O55144 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tlx3O55144 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tlx3O55144 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tlx3O55144 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tlx3O55144 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tlx3O55144 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tlx3O55144 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tlx3O55144 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tlx3O55144 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tlx3O55144 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tlx3O55144 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Tlx3O55144 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tlx3O55144 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tlx3O55144 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tlx3O55144 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tlx3O55144 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tlx3O55144 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Tlx3O55144 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tlx3O55144 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tlx3O55144 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tlx3O55144 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Tlx3O55144 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tlx3O55144 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tlx3O55144 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tlx3O55144 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tlx3O55144 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tlx3O55144 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tlx3O55144 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tlx3O55144 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tlx3O55144 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tlx3O55144 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tlx3O55144 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tlx3O55144 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tlx3O55144 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tlx3O55144 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tlx3O55144 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Tlx3O55144 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Tlx3O55144 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tlx3O55144 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms